Molecular characterization of antibiotic resistant salmonella spp. and Escherichia coli from poultry and human isolates

การตรวจระดับอณูชีวโมเลกุลของเชื้อ Salmonella spp. และ Escherichia coli ที่ดื้อต่อยาต้านจุลชีพที่แยกได้จากไก่เลี้ยงในฟาร์มและมนุษย์

Name: Paweena Kongsanan

MeSH: Microbiology

MeSH: Molecular epidemiology

MeSH: Salmonella infections in animals

Abstract: Food animal industry is important for the development of every country. Several classes of antibiotic agents are used in poultry farming to prevent economic loss suffered from infectious diseases. This study was performed to determine the prevalence of antibiotic resistant Salmonella and Escherichia coli in chicken, poultry farmers, and patients. A total of 121 Salmonella and 97 E. coli isolated were collected from Khon Kean, Ratchaburi and Phayao provinces in 2012-2013. Salmonella and E. coli from chicken showed a high rate of resistance to nalidixic acid and tetracycline. A total of 64% of Salmonella and E. coli were positive for intI1 by using specific primers for intI1. Resistance genes identified in this study were aadA2 (conferring resistance to aminoglycosides), sat (to streptothricin), blaPSE-1(to β-lactams), dhfr12 (to trimethoprim), and lnuF (to lincosamide). Twenty-three Salmonella and 6 E. coli isolates with resistance to nalidixic were selected for studies gyrA and parC. Amino acid substitutions in S83 and D87 of the target site, GyrA, were predominant in this study. Among 121 Salmonella isolates, 15 serotypes were found and the most common was S. Enteritidis. IncI1 and IncA/C were the common plasmid replicon types among Salmonella isolates, while IncFIB type was predominant in E. coli isolates. Interestingly, IncFIB was commonly found in (6%) Salmonella and (54%) E. coli bacteremia patients, and also found in (59%) chicken and (20%) farmer isolates. The clonal relationship between chicken and human isolates was demonstrated by molecular typing methods, including plasmid profile typing, ERIC-PCR, PFGE and HiMLST. HiMLST showed the spread of ST11 clonal among chicken and human isolates. This study showed possible outbreak of Salmonella in Thailand, and link between resistant bacteria from poultry farms and from food chain via vertical (clonal spread) and horizontal (gene spread) transmission. The antimicrobial agent control policy in animal farming should be strengthened in order to reinstate infection control and prevent the spread of resistant bacteria.

Abstract: อุตสาหกรรมการผลิตอาหารจากสัตว์ถือเป็นอุตสาหกรรมสำคัญในประเทศ ยาต้านจุลชีพหลายขนานจึงถูกนำมาใช้ในการเลี้ยงสัตว์ปีกในฟาร์ม เพื่อป้องกันการสูญเสียทางเศรษฐกิจอันเนื่องมาจากโรคติดเชื้อต่างๆ การศึกษาครั้งนี้ได้ทำการทดสอบหาความชุกของเชื้อ Salmonella spp. และ Escherichia coli ที่ดื้อต่อยาต้านจุลชีพ โดยเชื้อแยกได้จากไก่ เกษตรกรผู้เลี้ยงไก่และผู้ป่วยที่ติดเชื้อ Salmonella spp. และ E. coli ในกระแสโลหิต เชื้อ Salmonella จำนวน 121 สายพันธุ์และ E. coli จำนวน 97 สายพันธุ์ ที่แยกได้จากจังหวัดขอนแก่น ราชบุรีและพะเยา ในปี พ.ศ. 2555-2556 พบว่าเชื้อ Salmonella spp. และ E. coli ที่แยกได้ส่วนใหญ่ดื้อต่อยานาลิดีซิกและเตเตร้าซัยคลิน การตรวจหา class 1 integron โดยการใช้ยีนเป้าหมาย intI1 พบว่าร้อยละ 64 ของทั้ง Salmonella spp. และ E. coli ให้ผลบวกต่อยีนดังกล่าว ยีนดื้อยาที่พบในการศึกษาครั้งนี้ประกอบด้วย aadA2 (ทำให้ดื้อยาในกลุ่มอะมิโนไกลโคไซค์), sat (ทำให้ดื้อยาในกลุ่มสเตรปโตทริซิน), blaPSE-1 (ทำให้ดื้อยาในกลุ่มเบต้าแลคแตม), dhfr12 (ทำให้ดื้อยาในกลุ่มไตรเมโทพริม), และ lnuF (ทำให้ดื้อยาในกลุ่มลินโคซาไมด์). เชื้อ Salmonella spp. 23 สายพันธุ์ และ E. coli 6 สายพันธุ์ซึ่งเป็นสายพันธุ์ที่ดื้อต่อยานาลิดิซิกถูกเลือกเพื่อนำไปศึกษาลำดับอะมิโนแอซิดในยีน gyrA และ parC พบการว่ามีการแทนที่ของอะมิโนแอซิดที่ตำแหน่ง S83 และ D87 ของยีน gyrA มากที่สุด เชื้อ Salmonella spp.ในการศึกษาครั้งนี้ มี 15 serotype และ serotype ที่พบได้บ่อยที่สุดคือ S. Enteritidis จากการทดสอบเพื่อจำแนกชนิดของ Plasmid replicon พบว่า IncI1 และ IncA/C เป็นชนิดที่พบได้มากในเชื้อ Salmonella spp. ขณะที่ IncFIB พบได้มากในเชื้อ E. coli ที่น่าสนใจคือ IncFIB พบได้บ่อยในคนไข้ที่ติดเชื้อในกระแสโลหิต ได้แก่ร้อยละ 6 ของเชื้อ Salmonella, ร้อยละ 54 ของเชื้อ E. coli และยังสามารถพบได้ในเชื้อที่แยกได้จากไก่ร้อยละ 59 และเกษตรกรผู้เลี้ยงไก่ร้อยละ 20 ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของเชื้อที่แยกได้ระหว่างไก่และมนุษย์ได้ทดสอบโดยวิธี plasmid profile typing, ERIC-PCR, PFGE, และ HiMLST ผลการทดสอบของ HiMLST แสดงให้เห็นถึงการแพร่กระจายของเชื้อ Salmonella spp. ชนิดสายพันธุ์ ST11 การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นถึงความสัมพันธ์ในระดับพันธุกรรมระหว่างเชื้อที่แยกได้จากไก่และมนุษย์ และแสดงให้เห็นถึงการระบาดของเชื้อ Salmonella ในประเทศไทย ทำให้เห็นถึงความเชื่อมโยงของเชื้อดื้อยาที่แยกได้จากฟาร์มไก่และมนุษย์ โดยจากการแพร่ระบาดทั้งในแนวตั้งตามชนิดของสายพันธุ์ (clonal spread) และแบบแนวนอนด้วยยีนดื้อยาชนิดเดียวกันในแบคทีเรียต่างสายพันธุ์ (Horizontal gene transfer) ผลที่ได้จากการศึกษาครั้งนี้สามารถนำไปใช้ประโยชน์ในการออกข้อกำหนดเพื่อควบคุมการใช้ยาต้านจุลชีพในอุตสาหกรรมของฟาร์มเลี้ยงสัตว์เพื่อที่จะควบคุมการแพร่กระจายและการเกิดเชื้อดื้อยาต้านจุลชีพ

Mahidol University. Mahidol University Library and Knowledge Center

Address: NAKHONPATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Chanwit Tribuddharat

Role: Thesis Advisors

Name: Somporn Srifuengfung

Role: Thesis Advisors

Name: Iyarit Thaipisuttikul

Role: Thesis Advisors

Name: Soraya Chaturongakul

Role: Thesis Advisors

Created: 2015

Modified: 2568-04-17

Issued: 2025-04-15

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

eng

DegreeName: Doctor of Philosophy

Level: Doctoral Degree

Descipline: Medical Microbiology

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	5136625.pdf	2.55 MB	12	2026-05-26 18:16:01

ใช้เวลา

0.332054 วินาที