Identification of genes and metabolites involved in Durian Durio zibethinus fruit ripening

การระบุยีนและเมแทบอไลต์ที่เกี่ยวข้องกับการสุกของผลทุเรียน Durio zibethinus

Name: Pinnapat Pinsorn

LCSH: Durian -- Flavor and odor

LCSH: Metabolites

LCSH: Genes -- Identification

Abstract: Durian (Durio zibethinus M.), a major economic fruit, actively produces infamous sulfur-containing compounds during ripening. However, sulfur metabolism which is important in this fruit is rarely investigated. In this study, the integration of metabolomics using CE-TOF/MS and transcriptomics using de novo RNA-seq assembly was performed to reveal metabolic changes involved in sulfur metabolism and chemical composition related to fruit quality. During ripening, the expression level of genes involved in sulfur metabolism is concurred with the reduced sulfate ion content in placenta and the up-accumulation of sulfur metabolism-related metabolites in pulps. It is noteworthy that durian pulps highly accumulate γ-glutamylcysteine (γ-EC) and glutathione as powerful antioxidants. According to real-time RT-qPCR analysis of genes involved in γ-glutamyl cycle during ripening, γ-EC was proposed to be a sulfur storage form in durian pulps. In addition, accumulation levels of cysteine and leucine, and expression levels of genes encoding polygalacturonase and ACC oxidase contributed to the differences between Mon Thong and Chanee cultivars were proposed. These findings provide valuable information as the first step to be exploited for durian fruit quality improvement through molecular breeding.

Abstract: กรดเบนโซอิก กรดซอร์บิก และกรดโพรพิโอนิกเป็นกรดอินทรีย์ที่นิยมใช้เป็นสารกันบูดในอาหารและมีการกำหนดปริมาณที่อนุญาตให้ใช้ กะปิเป็นอาหารหมักที่ใช้เป็นส่วนประกอบในอาหารไทยหลายชนิด เนื่องจากกะปิมีเมทริกซ์ที่ซับซ้อน จึงต้องมีขั้นตอนการเตรียมตัวอย่างก่อนการวิเคราะห์หาปริมาณสารกันบูดกลุ่มกรดอินทรีย์ในกะปิ ในงานวิจัยนี้ได้พัฒนาเทคนิคการสกัดระดับจุลภาคด้วยวัฏภาคของแข็งแบบเฮดสเปซ (HS-SPME) เพื่อสกัดสารกันบูดกลุ่มกรดอินทรีย์ในกะปิและนำไปวิเคราะห์ด้วยเทคนิคแก๊สโครมาโทกราฟีที่มีเครื่องตรวจวัดแบบเฟลมไอออนไนเซชัน (GC-FID) โดยใช้พอลิอะคริเลตไฟเบอร์ เคลือบหนา 85 ไมโครเมตร ในการสกัดสารจากเฮดสเปซและชะสารออกโดยใช้ความร้อนที่อุณหภูมิ 250 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 5 นาที ที่ส่วนนำสารเข้าของ GC โดยภาวะที่เหมาะสมในการสกัดด้วย HS-SPME คือ อุณหภูมิในการสกัด 50 องศาเซลเซียส เวลาในการสกัด 30 นาที ใช้กะปิ 0.1 กรัม ละลายในกรดซัลฟิวริกเข้มข้น 0.05 โมลาร์ ปริมาตร 10 มิลลิลิตร และเติมเกลือโซเดียมซัลเฟต 4.5 กรัม สำหรับการตรวจสอบความใช้ได้ของวิธีวิเคราะห์ ได้ช่วงความเป็นเส้นตรงของการวิเคราะห์ที่ดีที่ความเข้มข้น 5 ถึง 150 มิลลิกรัมต่อลิตร โดยมีค่าสัมประสิทธิ์การถดถอย (R2) เท่ากับ 0.9941-0.9997 ขีดจำกัดการตรวจหา (LODs) และขีดจำกัดการวัดปริมาณ (LOQs) ของวิธีเท่ากับ 1.1-1.7 มิลลิกรัมต่อลิตร และ 3.2-5.2 มิลลิกรัมต่อลิตร ตามลำดับ นอกจากนี้ ร้อยละการคืนกลับของการสกัดที่ความเข้มข้น 50 มิลลิกรัมต่อลิตรในกะปิ อยู่ในช่วงร้อยละ 83-109 ความเที่ยงของวิธีได้ค่ายอมรับได้โดยค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานสัมพัทธ์ในวันเดียวกันเท่ากับร้อยละ 4.41-10.4 และต่างวันกันร้อยละ 0.75-9.04 เมื่อใช้ภาวะที่เหมาะสมของ HS-SPME ในการวิเคราะห์สารกันบูดกลุ่มกรดอินทรีย์ทั้ง 3 ชนิด ในตัวอย่างจริง ได้ค่าความแม่นและความเที่ยงของการวิเคราะห์ที่ดี

Chulalongkorn University. Office of Academic Resources

Address: BANGKOK

Email: cuir@car.chula.ac.th

Name: Supaart Sirikantaramas

Role: advisor

Created: 2018

Modified: 2025-02-09

Issued: 2024-10-20

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

URL: https://digiverse.chula.ac.th/Info/item/dc:93258

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Biochemistry and Molecular Biology

Grantor: Chulalongkorn University

©copyrights Chulalongkorn University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	5972025823.pdf	3.71 MB

ใช้เวลา

0.02375 วินาที