การพัฒนาเครื่องหมายดีเอ็นเอที่จำเพาะต่อชนิดของปูในวงศ์ปูม้า Portunus pelagicus, P. samguinolentus, P. gladiator, charybdis feriatus and C. natator

Development of species-specific DNA marker of crab species in the family portunidae : portunus pelagicus, P. samguinolentus, P. gladiator, harybdis feriatus and C. natator

Name: สองเมือง สุวรรณรัตน์

ThaSH: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ -- วิทยานิพนธ์. วท.ม. (พันธุศาสตร์) 2560

Classification :.LCCS: SH380.47.B59

ThaSH: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. สาขาพันธุศาสตร์ -- วิทยานิพนธ์

ThaSH: ปูม้า -- พันธุศาสตร์

ThaSH: เครื่องหมายพันธุกรรม

Abstract: เครื่องหมายโมเลกุลเพื่อระบุชนิดของกลุ่มปูในวงศ์ปูม้า (family Portunidae) ซึ่งเป็นปูที่มีความสำคัญต่อเศรษฐกิจของประเทศไทยถูกพัฒนาขึ้นโดยอาศัยเทคนิค multiplex PCR โดยชุดไพรเมอร์สำหรับปฏิกิริยาพีซีอาร์ออกแบบจากข้อมูลของยีน cytochrome b เพื่อให้จำเพาะกับปูม้า 5 ชนิด คือปู 5 ชนิด ได้แก่ P. sanguinolentus, P.pelagicus, P.gladiator, C. feriatusและ C. natator โดยมีขนาดของแถบผลผลิตพีซีอาร์ที่จำเพาะต่อปูแต่ละชนิดเท่ากับ 418 348 286 481 และ124คู่เบสตามลำดับ ผลการทดสอบความจำเพาะ (Specificity) ของชุดไพรเมอร์พบว่าไม่มีการเพิ่มปริมาณชิ้นดีเอ็นเอที่แตกต่างไปจากเป้าหมายที่ออกแบบไว้ ผลการทดสอบความไว (Sensitivity) ของชุดไพรเมอร์ พบว่าสามารถตรวจพบแถบดีเอ็นเอของผลผลิตพีซีอาร์ได้เมื่อปริมาณดีเอ็นเอ ต้นแบบในปฏิกิริยาพีซีอาร์เท่ากับหรือมากกว่า 0.1 นาโนกรัม ทั้งจากตัวอย่างดีเอ็นเอต้นแบบที่เป็นปูเป้าหมายชนิดเดียวและดีเอ็นเอต้นแบบที่มีการผสมกันของดีเอ็นเอจากปูมากกว่าหนึ่งชนิด นอกจากนี้เมื่อทดสอบเครื่องหมายโมเลกุลที่พัฒนาขึ้นกับผลิตภัณฑ์ปูปรุงสุกและผลิตภัณฑ์ปูแปรรูปอื่น ๆ จากท้องตลาดและร้านสะดวกซื้อ พบว่าสามารถระบุชนิดของปูที่ถูกใช้เป็นวัตถุดิบในผลิตภัณฑ์การตรวจสอบด้วยวิธีแคปิลารีอิเลคโตรโฟรีซีสสามารถเพิ่มความไวในการตรวจสอบมากขึ้น ผลที่ได้ทั้งหมดนี้แสดงให้เห็นว่าเครื่องหมายที่พัฒนาขึ้นนี้สามารถนำไปใช้ประโยชน์ได้ในอุตสาหกรรมที่เกี่ยวข้องกับปูม้าต่อไป The molecular markers for species identification of crabs in Portunidae family are economically important species in Thailand. This molecular marker was developed by using multiplex PCR technique by species specific primers set were designed by using DNA sequence of cytochrome b gene for specific with 5 species of crabs such as Portunus sanguinolentus, P. pelagicus, P. gladiator, C. feriatus and C. natator that’s giving the amplicon size in 418, 348, 286, 481 and 124 bp respectively, The result the specificity examination from these primers show no amplification from non-target crab species. The sensitivity examination of these primers found that could amplify the DNA fragment in the lowest concentration of DNA template at 0.1 ng/ul with the both of single DNA template and mixed DNA template more than one species. Moreover, this marker were tested with the cooked crab meat and other crab meat product from local market, convenient store and super market. The processed food examination indicate that could identify crab species that were used as ingredients. The development of this set of primer was able to detect specific DNA fragment of crab by either normal agarose gel electrophoresis or automated capillary electrophoresis for fast and convinientThe result of all these work show that the improve molecular marker can be utilized in industries related to crabs.

มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. สำนักหอสมุด

Address: กรุงเทพมหานคร

Email: tdckulib@ku.ac.th

Name: ประดิษฐ์ แสงทอง

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์หลัก

Name: สมพิศ สามิภักดิ์

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์ร่วม

Created: 2560

Modified: 2566-05-19

Issued: 2566-05-19

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

URL: https://kasetsart.idm.oclc.org/login?url=https://www.lib.ku.ac.th/KUthesis/2560/songmeung-suw-all.pdf

CallNumber: SH380.47.B59.ส19

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: พันธุศาสตร์

Grantor: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

©copyrights มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	songmeung-suw-all.pdf	3.31 MB

ใช้เวลา

0.025147 วินาที