ความหลากหลายทางพันธุกรรม และการจำแนกสายพันธุ์ของ Eurycoma longifolia Jack ในประเทศไทยด้วยเครื่องหมายเอเอฟแอลพี

Genetic diversity and varietal identification of eurycoma longifolia jack in Thailand using amplified fragment length polymorphism (AFLP) marker

Name: วิจิตรา สถิตย์บุตร

ThaSH: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ -- วิทยานิพนธ์. วท.ม. (พืชไร่) 2559.

Classification :.LCCS: QK495.S59

ThaSH: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. -- สาขาพืชไร่ -- วิทยานิพนธ์

ThaSH: ปลาไหลเผือก (พืช) -- พันธุศาสตร์

ThaSH: เครื่องหมายพันธุกรรม

การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของต้นปลาไหลเผือก (Eurycoma longifoliaJack) ในประเทศไทยจำนวน 82 ตัวอย่าง และต้นปลาไหลเผือกน้อย (Eurycoma harmandiana Pierre) จำนวน 2 ตัวอย่าง โดยใช้เครื่องหมาย amplified fragment length polymorphism (AFLP) จำนวน 15 คู่ไพรเมอร์ ซึ่งได้จำนวนแถบดีเอ็นเอทั้งสิ้น 323 แถบ โดยมีแถบที่เป็นพอลิมอร์ฟิซึม 243 แถบ คิดเป็น 75.23 เปอร์เซ็น ของจำนวนแถบดีเอ็นเอทั้งหมด ค่า polymorphism information content (PICs) เฉลี่ยแต่ละไพรเมอร์มีค่าอยู่ในช่วงระหว่าง 0.091-0.199 โดยมีค่าเฉลี่ยของทั้งหมดเท่ากับ 0.151 ซึ่งบ่งบอกถึงความสามารถของเครื่องหมายดีเอ็นเอในการแยกแยะตัวอย่างในระดับค่อนข้างสูง ค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงทางพันธุกรรม (similarity coefficient) อยู่ในช่วง 0.60-0.97 โดยมีค่าเฉลี่ยเท่ากับ 0.76 ซึ่งค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงสูงสุดเท่ากับ 0.97 แสดงให้เห็นว่าแต่ละตัวอย่างที่นำมาตรวจสอบมีความแตกต่างกันทางพันธุกรรมหรือเป็นคนละสายพันธุ์นั่นเอง และเมื่อสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ที่ค่าสัมประสิทธ์ความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมประมาณ 0.68 สามารถแยกกลุ่มตัวอย่างของต้นปลาไหลเผือกน้อย (outgroups) ออกจากกลุ่มตัวอย่างของต้นปลาไหลเผือก เมื่อสังเกตที่ค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมที่ 0.78 พบว่าสามารถแบ่งกลุ่มตัวอย่างต้นปลาไหลเผือกได้ทั้งสิ้น 6 กลุ่ม ซึ่งแต่ละกลุ่มมีความสอดคล้องกับพื้นที่ที่เก็บรวบรวม เมื่อนำข้อมูลมาวิเคราะห์ด้วยวิธี principal coordinate analysis (PCoA) สามารถแบ่งตัว อย่างได้เป็น 3 กลุ่ม สอดคล้องกับการจัดกลุ่มของแผนภูมิทางพันธุกรรมที่ระดับความคล้ายคลึงทางพันธุกรรมประมาณ 0.75 จากการศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาของต้นปลาไหลเผือก พบว่าสามารถจำแนกต้นปลาไหลเผือกน้อยและต้นปลาไหลเผือกได้อย่างชัดเจน แต่ไม่สามารถจำแนกความแตกต่างภายในประชากรของต้นปลาไหลเผือกได้อย่างชัดเจน Amplification fragment length polymorphism (AFLP) was utilized in a study of 82 accessions of Eurycoma Longifolia and 2 accessions of Eurycoma harmandiana, which acted as an out-group. Fifteen AFLP primer combinations generated a total of 323 fragments, where 243 bands were polymorphic. The percentage of polymorphic loci was 75.23% of the total bands. Polymorphism information content (PICs) of the total band had an average value of 0.151, representing high discriminating power given that the average for each of primer combination value ranged from 0.091-0.199. The estimated pairwise similarity value ranged from 0.60-0.97, with an average value of 0.67. The maximum similarity coefficients of 0.97 indicates the genetic variation in each accession, further categorizing the accessions into unique, different species. A phylogenetic tree was constructed using similarity coefficients. The two clusters were divided based on the similarity coefficients, at 0.68; cluster 1 consisted of accession of E. longifolia, and cluster 2 consisted of accession of E. harmandiana. Interestingly, E. longifolia accessions can be divided into six groups when the similarity coefficients reached 0.78. The groupings were also related to their collected location. Principal coordinate analysis (PCoA) further divide into three groups, which correlate with the clustering of phylogenetic tree at similarity coefficients of 0.75. In the study of the morphology of all accessions, a clear distinction between E. Longifolia and E. harmandiana can be established; however, the within-species distinction in E. Longifolia was still unclear.

มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. สำนักหอสมุด

Address: กรุงเทพมหานคร

Email: tdckulib@ku.ac.th

Name: วิเชียร กีรตินิจกาล

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์หลัก

Name: สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์ร่วม

Created: 2559

Modified: 2566-05-09

Issued: 2566-05-09

วิทยานิพนธ์/Thesis

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

URL: https://kasetsart.idm.oclc.org/login?url=https://www.lib.ku.ac.th/KUthesis/2559/vijittra-sat-all.pdf

CallNumber: QK495.S59 .ว32

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: พืชไร่

Grantor: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

©copyrights มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	vijittra-sat-all.pdf	5.09 MB	1	2024-10-10 21:35:27

ใช้เวลา

0.039381 วินาที