Development in detection of hla-B*1502 and -B*5801 by ssp-pcr and lamp with pna probe

การพัฒนาวิธีการตรวจหาเอชแอลเอบี 1502 และ 5801 ด้วยวิธีเอสเอสพีพีซีอาร์ และแลมพ์โดยใช้พีเอนเอ

Name: Sita Virakul

LCSH: Drug allergy

LCSH: Drug allergy -- Genetic aspects

LCSH: Drug allergy -- Testing

Abstract: Pharmacogenetics in HLA allele is very useful for risk assessment in life-threatening drug hypersensitivity. In 2004, HLA-B*1502 first showed strong association with carbamazepine hypersensitivity. Another association, HLA-B*5801 involved with allopurinol hypersensitivity. Since allele frequencies of these HLA-B alleles are quite common in Asian ethnicity and with 26% mortality rate in patients, it is important to develop a rapid and cost effective test for Asian, including our Thai population. To get a HLA type, commercially available SSP-PCR is too expensive. So, in-house SSP-PCR would be the most interesting candidates comparing to other molecular techniques. From this study, HLA-B*1502 can be interpreted specifically by simple nested SSP-PCR, while HLA-B*5801 can be differentiated by only one set of primer with 100% sensitivity and >99.9% specificity. Moreover, blood PCR kit can be applied to both HLA-B*1502 and HLA-B*5801 with the same specificity. Furthermore, LAMP was introduced to HLA typing as an alternative method. LAMP is an isothermal amplification technique which its specificity comes from 4 primers at a time. In this study, HLA-B*5801 can be identified with 95.24% sensitivity and 83.78% specificity. The benefit of these tests would help patients to avoid any life-threatening adverse consequences.

Abstract: ในปัจจุบันสามารถทำนายการเกิดการแพ้ยาอย่างรุนแรงได้โดยการหาเอชแอลเอยีน โดยเอชแอลเอตัวแรกที่มีการรายงานคือ เอชแอลเอบี 1502 ซึ่งมีความสัมพันธ์กับการแพ้ยากันชักชื่อคาร์บามาซีพีน อีกยีนหนึ่งคือเอชแอลเอบี 5801 มีสัมพันธ์กับยารักษาโรคเกาต์ชื่ออัลโลพูรินอล ยีนเหล่านี้มีความสำคัญมากเนื่องจากเป็นยีนที่พบมากในกลุ่มประชากรเอเชีย ร่วมกับมีอัตราการตายจากการแพ้ยาอยู่ที่ประมาณ 26 เปอร์เซ็นต์ จึงมีความสำคัญในการหาวิธีตรวจยีนที่ได้ผลถูกต้อง ราคาเหมาะสม และรวดเร็ว วิธีหนึ่งก็คือ เอสเอสพีพีซีอาร์ ในปัจจุบันมีชุดตรวจสำเร็จแต่ราคายังคงแพงเกินไป จึงควรมีการพัฒนาเอสเอสพีพีซีอาร์อย่างง่าย และราคาถูกเพื่อใช้เองภายในประเทศ จากงานวิจัยในครั้งนี้สามารถทำนายเอชแอลเอบี 1502 และเอชแอลเอบี 5801 ได้ความไว 100% และแม่นยำ >99.9% ในขั้นต่อมาได้นำวิธีการทำนายเอชแอลเอบี 1502 และเอชแอลเอบี 5801 ไปใช้กับชุดพีซีอาร์จากเลือดโดยตรง ซึ่งให้ผลที่มีความจำเพาะได้เท่าเทียมชุดพีซีอาร์แบบดั้งเดิม ทำให้สามารถลดขั้นตอนและค่าใช้จ่ายในการแยกสารพันธุกรรมจากเลือดได้ นอกจากนี้แล้วยังมีการใช้วิธีอื่นเข้ามาช่วยการหาเอชแอลเอเช่น วิธีแลมพ์ อันเป็นวิธีการเพิ่มจำนวนสารพันธุกรรมที่อุณหภูมิเดียว โดยอาศัยไพร์เมอร์ 4 เส้นในการทำนายชนิดของเอชแอลเออย่างจำเพาะ จากงานวิจัยในครั้งนี้สามารถทำนายเอชแอลเอบี 5801 ได้ความไว 95.24% และแม่นยำ 83.78% ประโยชน์ของงานวิจัยนี้ทำให้สามรถช่วยคนไข้ไม่ให้เกิดอาการแพ้ที่รุนแรงถึงชีวิตได้ตั้งแต่ก่อนการให้ยา

Chulalongkorn University. Office of Academic Resources

Address: BANGKOK

Email: cuir@car.chula.ac.th

Name: Tirayut Vilaivan

Role: Advisor

Name: Piyasak Chaumpluk

Role: Advisor

Created: 2009

Modified: 2020-09-08

Issued: 2020-06-21

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

URL: http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/56915

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Medical Microbiology

Grantor: Chulalongkorn University

©copyrights Chulalongkorn University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	Sita Virakul.pdf	1.74 MB	4	2020-08-26 14:23:45

ใช้เวลา

0.034958 วินาที