Proteomic analysis of differently expressed proteins in penaeus vannamei survivors after acute yellow head virus infection

การศึกษาความแตกต่างของแบบแผนโปรตีนในกุ้ง penaeus vannamei ที่อยู่รอดจากการติดเชื้อไวรัสหัวเหลืองอย่างเฉียบพลัน

Name: Triwit Rattanarojpong

LCSH: Hemocyanin

LCSH: Polymerase Chain Reaction -- methods

LCSH: Penaeus vannamei

LCSH: Yellow head virus

Abstract: Yellow head virus is a highly virulent shrimp pathogen that can cause mass mortalities in farmed penaeid shrimp. To define the change of the protein expression profile of YHV infection, a comparative analysis of proteomic profiles of control and YHV-infected was performed in gill of shrimp by 2-DE. In this proteomic analysis of gills from YHV-infected Penaeus vannamei, we identified 13 spots with up-regulated protein expression levels and 5 spots with down-regulated levels. LC-nanoESI-MS/MS indicated that the up-regulated proteins included enzymes in the glycolytic pathway, the TCA cycle and amino acid metabolism. The other up-regulated proteins were arginine kinase, imaginal disc growth factor (IDGF) and a Ras-like GTP binding protein. By contrast, expression levels were reduced for sarcoplasmic calcium binding proteins (SCPs), actin-1, valosincontaining protein and Rab11. The expression of SCP and enolase by Western blot and imuno-fluorescence also revealed the change in the level of these proteins after YHV infection corresponding to 2-DE results. However, time-course assays by Real time RT-PCR revealed no significant increase in mRNA level of glycolytic enzymes and arginine kinase except a significant decrease in SCP mRNA. When screening of SCP promoter from fosmid DNA library of P. monodon, some clones from the library possibly contained SCP promoter. The results presented here provide preliminary data on the interaction between YHV and more insights into the pathogenesis and mechanism of YHV infection in P. vannamei in the future.

Abstract: ไวรัสหัวเหลืองเป็นไวรัสที่ก่อให้เกิดการตายของกุ้งในฟาร์มเลี้ยงกุ้ง ในงานวิจัยนี้ได้ทำการ เปรียบเทียบการแสดงออกและการเปลี่ยนแปลงของโปรตีนในเหงือกของกุ้งที่ติดเชื้อไวรัสหัว เหลืองโดยใช้เทคนิคแผ่นเจลพอลิอะคริลาไมด์แบบสองมิติ จากผลการวิเคราะห์การแสดงออก และเปลี่ยนแปลงของโปรตีนพบว่ามีโปรตีนที่มีการแสดงออกเพิ่มขึ้น 13 ชนิดและลดลง 5 ชนิด ผลการวิเคราะห์ชนิดของโปรตีนโดยเทคนิคทางแมสสเปคโตรเมททรี พบว่าโปรตีนที่มีการ แสดงออกเพิ่มขึ้นคือเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับขบวนการไกลโคไลซิส, วัฎจักร TCA และ ขบวนการ เมตาบอลิสซึมของอะมิโนแอซิค โปรตีนชนิดอื่นๆที่มีการแสดงออกเพิ่มขึ้นได้แก่ arginine kinase, imaginal disc growth factor (IDGF) และ Ras-like GTP binding protein ส่วนโปรตีน ที่มีการแสดงออกลดลงคือ sarcoplasmic calcium binding proteins (SCPs), actin-1, valosincontaining protein และ Rab11 เมื่อวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของ SCP และ enolase โดยวิธี Western blot และ immuno-fluorescence พบว่าการเปลี่ยนแปลงของโปรตีนทั้งสองชนิดนี้ ให้ผลตรงกับผลที่ได้จากแผ่นเจลพอลิอะคริลาไมด์แบบสองมิติ อย่างไรก็ตามผลจาก Real time RT-PCR พบว่าไม่มีการลดลงของระดับเอ็มอาร์เอ็นเอของเอ็นไซม์ที่เกี่ยวข้องกับขบวนการไกล โคไลซิส และ arginine kinase ยกเว้นเอ็มอาร์เอ็นเอของ SCP นอกจากนี้ผลจากการหาโปรโม เตอร์ที่ควบคุมการแสดงออกของ SCP จากห้องสมุดฟอสมิดดีเอ็นเอของกุ้งลาดำ (P. monodon) พบโคลนที่มีความเป็นไปได้ที่จะมีโปรโมเตอร์ของ SCP อยู่ ผลการทดลองที่ได้ทั้งหมดทำให้ได้ ข้อมูลเบื้องต้นสำหรับการศึกษาปฎิสัมพันธ์ระหว่างไวรัสหัวเหลืองกับกุ้งอันจะนำไปสู่การศึกษา ในรายละเอียดในขบวนการก่อโรคของไวรัสชนิดนี้ในระดับโมเลกุลในกุ้งขาวต่อไปในอนาคต

Mahidol University

Address: NAKHONPATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Fkegekm Timothy W

Role: Thesis Advisors

Created: 2009

Modified: 2553-06-18

Issued: 2010-06-18

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

CallNumber: TH T842p 2009

eng

DegreeName: Doctor of Philosophy

Level: Doctoral Degree

Descipline: Biotechnology

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4736177.pdf	5.95 MB	16	2018-05-29 13:57:22

ใช้เวลา

-0.672845 วินาที