A study of the association between CTLA-4, TAB2 and SUMO4 genes polymorphisms and type 1 diabetes in the Thai population

การศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างความแปรผันของยีน CTLA-4. TAB2 และโรคเบาหวานชนิดชนิดที่ 1 ในประชากรไทย

Name: Kanjana Leejinda

MeSH: Autoimmune Diseases

MeSH: Diabetes Mellitus, Type 1

MeSH: Polymorphism, Single Nucleotide

MeSH: Polymorphism, Restriction Fragment Length

Abstract: Type 1 diabetes is a multifactorial disease, in which both genetic and environmental factors have been implicated in its pathogenesis. Several genes are involved in the mechanism of controlling immune responses which is likely to be contributed to the development of autoimmune disease. These include CTLA-4, TAB2 and SUMO4. CTLA-4, located on chromosome 2q33, which has been shown to play an inhibitory role in the regulation of T cell activation, leading to limitation of immune response. TAB2 and SUMO4, located on chromosome 6q25, are involved in the regulation of NF-kB activation which controls cellular proliferation and apoptosis in the immune and inflammatory response. Thus, from functional points of view, they might be candidate genes that could be related to type 1 diabetes. The genetic studies have shown the association between polymorphisms of these genes and type 1 diabetes in several populations. Since the genes that cause susceptibility to the disease could be different among various ethnic populations, the aim of this study was to investigate whether there is an association between any single nucleotide polymorphisms (SNPs) of these genes and type 1 diabetes in Thai population. The single nucleotide polymorphism (SNPs) including SNP-318C>T, SNP49A>G of CTLA-4, SNP001Msp, SNP268Hha and SNP012Taq of TAB2 and SNP163A>G of SUMO4 genes were chosen for the study of their association with type 1 diabetes in Thai patients. Eighty seven type 1 diabetic patients and 129 nondiabetic controls were recruited. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) and mismatch PCR-RFLP analysis followed by DNA direct sequencing were the method. It was found that genotype and allele frequencies of these SNPs were not significantly difference between type 1 diabetic patients and non-diabetic controls. In conclusion, the results of this study suggest that there is no association between any studied SNPs of the CTLA-4, SUMO4 and TAB2 genes and type 1 diabetes in Thai population. However, a larger sample size should be tested before any definite conclusion is drawn.

Abstract: โรคเบาหวานชนิดที่ 1 เป็นโรคออโตอิมมูนชนิดหนึ่งเกิดจากปัจจัยทั้งทางด้านพันธุกรรมและ สิ่งแวดล้อม มีการค้นพบว่ายีนหลายยีนมีความเกี่ยวข้องในการควบคุมกลไกต่างๆในการตอบสนองของระบบ ภูมิคุ้มกัน อาจจะส่งผลต่อการเกิดภาวะออโตอิมมูนได้ ซึ่ง ยีนดังกล่าวได้แก่ CTLA-4, TAB2 และ SUMO4 CTLA-4 อยู่บนโครโมโซม 2q33 มีบทบาทสำคัญในการยับยั้งการกระตุ้น T cells ซึ่งนำไปสู่การยับยั้งการ ตอบสนองต่างๆของระบบภูมิคุ้มกัน ในขณะที่ยีน TAB2 และ SUMO4 ซึ่งอยู่บนโครโมโซม 6q25 มีความ เกี่ยวข้องในการควบคุมการกระตุ้น NF-kB จากบทบาทหน้าที่ดังกล่าว จึงอาจเป็นไปได้ว่ายีนเหล่านี้อาจจะ เกี่ยวข้องกับการเกิดโรคเบาหวานชนิดที่ 1 ผลจากการศึกษาทางด้านพันธุกรรมพบว่าความแปรผันของยีนเหล่านี้มี ความสัมพันธ์กับโรคเบาหวานชนิดที่ 1ในประชากรหลายเชื้อชาติ อย่างไรก็ตามยีนที่มีผลต่อการเกิดโรคใดโรค หนึ่งอาจแตกต่างกันได้ในกลุ่มประชากรที่ต่างกัน ดังนั้นจึงน่าสนใจที่จะศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างความแปรผัน (single nucleotide polymorphisms, SNPs) ของยีน CTLA-4, TAB2 และ SUMO4 กับโรคเบาหวานชนิด ที่ 1 ในประชากรไทย ความแปรผัน (SNPs) ของยีน CTLA-4, TAB2 และ SUMO4 ที่เลือกศึกษาได้แก่ SNP-318C>T, SNP49A>G ของยีน CTLA-4; SNP001Msp, SNP268Hha และ SNP012Taq ของยีน TAB2; SNP163A>G ของยีน SUMO4 ผู้วิจัยได้ทำการตรวจหา SNPs ดังกล่าวในกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานชนิดที่ 1จำนวน 87 คน เทียบกับกลุ่มควบคุม จำนวน 129 คน ด้วยวิธี polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms และ mismatch PCR-RFLP และตรวจยืนยันตำแหน่งความแปรผันด้วยวิธี direct sequencing ผลการศึกษาพบว่าทั้ง genotype และ allele frequencies ของ SNPs ที่ศึกษาดังกล่าว ไม่มีความ แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ระหว่าง กลุ่มเบาหวานชนิดที่ 1 เทียบกับกลุ่มควบคุม โดยสรุป จากการศึกษานี้ไม่พบว่ามีความสัมพันธ์ระหว่าง SNPs ใดๆที่ทำการศึกษา ของยีน CTLA-4, TAB2 และ SUMO4 กับโรคเบาหวานชนิดที่ 1ในประชากรไทย อย่างไรก็ตามก่อนที่จะสรุปผลได้อย่างแน่นอน ควรที่จะทดสอบเพื่อยืนยันผลในกลุ่มประชากรที่ขนาดใหญ่มากขึ้นก่อน

Mahidol University

Address: NAKHON PATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Napatawn Banchuin

Role: Thesis Advisors

Created: 2007

Modified: 2553-06-17

Issued: 2010-06-10

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

CallNumber: TH K16st 2007

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Immunology

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4636419.pdf	2.9 MB	42	2024-12-23 18:02:54

ใช้เวลา

-0.636925 วินาที