Genotypic patterns of Salmonella isolated from various sources in the chicken farms and market by using pulsed-field gel electrophoresis

รูปแบบพันธุกรรมของเชื้อซัลโมเนลล่าที่แยกได้จากแหล่งต่าง ๆ ในฟาร์มเลี้ยงไก่และตลาดด้วยวิธี Pulsed-field gel electrophoresis

Name: Srirat Pornruangwong

LCSH: Chicken industry

LCSH: DNA -- analysis

LCSH: Pulsed-field gel electrophoresis -- Technique

MeSH: Electrophoresis, Gel, Pulsed-Field

MeSH: Salmonella

Abstract: This study was conducted to determine the antimicrobial resistance and genotypic patterns of a total of 112 strains of salmonellae isolated from three chicken farms in Phra Nakorn Si Ayuttaya province and Klong Toey market; which were used in a prior study in 2000. Fifty-one S. Braenderup, 24 S. Emek, 14 S. Weltevreden, 12 S. Derby, and 11 S. Stanley strains were examined using the antimocrobial susceptibility test and characterized by XbaI PFGE typing. Fifty three salmonellae strains (47.3%, 53/112) were resistant to 4 antimicrobial agents; namely nalidixic acid (NA) 37.5%, sulfamethoxazole-trimethoprim (SXT) 33.9%, tetracycline (TE) 25.9%, and ampicillin (AMP) 2.7%. All isolates were sensitive to cefotaxime (CTX) and choramphenicol (C). The prevalence of multidrug-resistant salmonellae (70%, 37/53) was significantly higher than those of single drug-resistant pattern strains (30%, 16/53, at p < 0.05). Moreover, 52.3% of salmonellae isolated from egg package (45/86) were antimicrobial resistant strains. XbaI PFGE typing was able to generate 7 patterns of S. Braenderup (A1-A7), 4 patterns of S. Emek (B1-B4), 4 patterns of S. Weltevreden (C1-C4), one genotype of S. Derby and 4 patterns of S. Stanley (E1-E4). The predominant clone of S. Braenderup was Type A2 (70.6%, 36/51) with 4 antibiotic sensitivity patterns. The most common patterns of Type A2 were sensitive to all tested antibiotics (63.9%, 23/36) and isolated from the egg packages at all three farms and the market. The SXT-NA-TE resistant strains of S. Emek, containing 3 PFGE types (B1-B3), were all from farm C (Phra Nakorn Si Ayuttaya province). All 12 strains of S. Derby isolated from farm A showed the same PFGE pattern with 3 antibiotic sensitivity patterns, and the most common pattern (83.3%, 10/12) was resistant to SXT-TE. PFGE Type E1 of S. Stanley was the most common clone (63.3%,7/11) and sensitive to tested antibiotics. PFGE typing was a significant method to differentiate and track down Salmonella strains that may cause an outbreak. The results of this study showed that the genetic related strain of Salmonella could be obtained from the chicken farms and the market. The same antimicrobial sensitivity pattern could be found in the different and distinct clones. Genotypic monitoring of salmonellae in the food chain could help to understand the wide spread of multidrug-resistant Salmonella.

Abstract: การศึกษาครั้งนี้เพื่อศึกษารูปแบบการดื้อยาและแบบแผนทางพันธุกรรมของเชื้อซัลโมเนลล่าจำนวน 112 สาย พันธุ์ที่แยกได้จากแหล่งต่างๆในฟาร์มเลี้ยงไก่จำนวน 3 ฟาร์มในจังหวัดพระนครศรีอยุธยาและตลาดคลองเตยจากการ ศึกษาวิจัยที่ได้ดำเนินการในปี ค.ศ. 2000 โดยสายพันธุ์ที่ศึกษามาจาก S. Braenderup 51 สายพันธุ์, S. Emek 24 สายพันธุ์, S. Weltrvreden 14 สายพันธุ์, S. Derby 12 สายพันธุ์ และ S. Stanley 11 สายพันธุ์ โดยทดสอบการดื้อต่อยาต้านจุลชีพ 6 ชนิด และศึกษารูปแบบทางพันธุกรรมของเชื้อด้วยวิธี Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) โดยตัดด้วยเอ็นไซม์ พบว่า 53 สายพันธุ์ (47.3%, 53/112) ดื้อต่อยาต้านจุลชีพ 4 ชนิดได้แก่ nalidixic acid (NA) ร้อยละ 37.5 รองลงมาคือ sulfamethoxazole-trimethoprim (SXT) ร้อยละ 33.9 tetracycline (TE) ร้อยละ 25.9 และ ampicillin (AMP) ร้อยละ 2.7 ไม่ พบสายพันธุ์ที่ดื้อต่อยา cefotaxime (CTX), choramphenicol (C) รูปแบบของการดื้อต่อยาต้านจุลชีพหลายชนิดพบร้อยละ 70 (37/53) ซึ่งสูงกว่าสายพันธุ์ที่มีการดื้อต่อยาต้านจุลชีพชนิดเดียวร้อยละ 30 (16/53) อย่างมีนัยสำคัญสถิติ (p< 0.05) อย่างไรก็ตามพบว่าร้อยละ 52.3 ของเชื้อที่แยกได้จากถาดพลาสติกบรรจุไข่ดื้อต่อยาต้านจุลชีพ การจำแนกรูปแบบทาง พันธุกรรมด้วยวิธี XbaI PFGE สามารถจำแนกรูปแบบทางพันธุกรรมของ S. Braenderup ได้ 7 แบบ (A1-A7), S. Emek 4 แบบ (B1-B4)), S. Weltevreden 4 แบบ (C1-C4 ), S. Derby 1 แบบ (D), and S. Stanley 4 แบบ ( E1-E4) ด้านความ สอดคล้องกันของรูปแบบทางพันธุกรรมกับการดื้อยาต้านจุลชีพพบว่า clone ที่เด่นของ S. Braenderup พบเป็น Type A2 ร้อยละ 70.6 (36/51) ซึ่งมีรูปแบบการดื้อยาต้านจุลชีพได้ 4 แบบ โดยรูปแบบธรรมดาที่พบมากร้อยละ 63.9 (23/36) เป็น Type A2 ที่ไม่ดื้อต่อยาต้านจุลชีพที่ใช้ทดสอบและเป็นเชื้อที่แยกได้จากถาดพลาสติกบรรจุไข่จากทุกฟาร์มและตลาด ในขณะที่เชื้อ S. Emek ที่ดื้อต่อยา SXT-NA-TE มีรูปแบบทางพันธุกรรม 3 ชนิดคือ B1-B3 และเป็นเชื้อที่แยกได้จาก ฟาร์ม C เท่านั้น S. Derby ทั้ง 11 สายพันธุ์ที่แยกได้จากฟาร์ม A นั้นมีรูปแบบทางพันธุกรรมแบบเดียวกันแต่มีการดื้อต่อ ยาต้านจุลชีพ 3 รูปแบบโดยที่ร้อยละ 83.3 (10/12) ดื้อต่อ SXT-TE ส่วนเชื้อ S. Stanley เป็น Type E1 ร้อยละ 63.6 (7/11) ซึ่งเป็น clone เด่นที่ไม่ดื้อยาต้านจุลชีพ การจำแนกรูปแบบทางพันธุกรรมด้วยวิธี PFGE เป็นวิธีที่เหมาะสมในการจำแนก และค้นหาสายพันธุ์ของเชื้อซัลโมเนลล่าที่อาจเป็นสาเหตุของการระบาด การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นสายพันธุ์ของเชื้อซัล โมเนลล่าที่มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมสามารถพบได้จากฟาร์มเลี้ยงไก่และตลาด รูปแบบการดื้อยาที่เหมือนกันสามารถ พบใน clone ที่แตกต่างและเหมือนกัน การใช้พันธุกรรมในการติดตามเชื้อซัลโมเนลล่าในห่วงโซ่อาหารสามารถช่วยให้มี ความเข้าใจในการแพร่กระจายของเชื้อซัลโมเนลล่าที่ดื้ต่ออยาต้านจุลชีพหลายชนิดได้

Mahidol University

Address: NAKHON PATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Orasa Suthienkul

Role: Thesis Advisors

Created: 2006

Modified: 2553-06-16

Issued: 2010-06-04

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

ISBN: 9740474748

CallNumber: TH S774g 2006

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Infectious Diseases and Epidemiology

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4536340.pdf	1.51 MB	20	2019-05-28 18:58:28

ใช้เวลา

0.309712 วินาที