The analysis of short tandem repeats on the x chromosome in the Thai population

การศึกษาวิเคราะห์ short tandem repeats บน chromosome x ในประชากรไทย

Name: Naowarat Nantachoat

keyword: Chromosomes, Human, X

; X Chromosome

Abstract: X-linked short tandem repeats (STRs) are increasingly used in forensic purposes, representing an efficient supplementation of autosomal and Y-chromosomal STRs analyses.In particular, Chromosome X haplotyping can clarify a complicated kinship situation. In this study, a monoplex reaction of five X-STRs, which includes the HPRTB, ARA, DXS101, DXS7423 and DXS8377 were analyzed in samples of 50 healthy unrelated females and 50 males from the Thai population. HPRTB, ARA and DXS7423 alleles consisted of variable numbers of a constant repetitive sequence. DXS101 and DXS8377 exhibited a complex structure with two type of repetition. The number of alleles found at each locus ranged from 3 to 19. Allele frequencies between male and female samples were not significantly different in all exmined markers. The exact test for genotype distribution of the markers showed no significant deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium except the ARA locus. The most polymorphic locus was found in DXS8377 with 16 alleles (HET = 0.898, PIC = 0.894, MEC = 0.890). All markers showed observed heterozygosities greater than 0.5. These data present that HPRTB, DXS101, DXS7423 and DXS8377 as useful markers for forensic application

Abstract: การตรวจ Short tandem repeats บน Chromosome X เพื่อใช้ในงานทางด้านนิติวิทยาศาสตร์กำลัง ได้รับความสนใจเพิ่มมากขึ้น เนื่องจากสามารถช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของการตรวจ autosomal และ chromosome Y โดยเฉพาะอย่างยิ่งสามารถช่วยแก้ปัญหาในกรณีคดีความสัมพันธ์พ่อ แม่ ลูกที่ซับซ้อนได้ การศึกษาครั้งนี้เป็นการศึกษา short tandem repeats (STRs) 5 ตำแหน่งบน Chromosome X ซึ่ง ได้แก่ HPRTB, ARA, DXS101, DXS7423 และ DXS8377 ในประชากรไทย ชาย 50 คนและหญิง 50 คน ผลการศึกษาพบว่า ตำแหน่ง HPRTB, ARA และ DXS7423 ประกอบด้วยคู่เบสซ้ำที่เป็นชุด เดียวกันเรียงตัวซ้ำกัน ในขณะที่ DXS101 และ DXS8377 ประกอบด้วยคู่เบสซ้ำ 2 ชุดเรียงตัวซ้ำกันอย่าง ซับซ้อน จำนวนอัลลีลที่พบในแต่ละตำแหน่งอยู่ระหว่าง 3 ถึง 19 อัลลีล และพบว่าความถี่ของอัลลีลในแต่ละ ตำแหน่งระหว่างชายและหญิงไม่มีความแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ การกระจายตัวของ genotype เมื่อทดสอบ ด้วย exact test พบว่าทุกตำแหน่งอยู่ในสมดุลของ Hardy-Weinberg ยกเว้นตำแหน่ง ARA ตำแหน่งที่มี ความหลากหลายมากที่สุด คือ DXS8377 ซึ่งพบทั้งหมด 16 อัลลีล ( HET = 0.898, PIC = 0.894, MEC = 0.890) โดยทุกตำแหน่งที่ทำการศึกษามีค่า observed heterozygosities มากกว่า 0.5 จากการศึกษาครั้งนี้ แสดงให้เห็นว่า Short tandem repeats บน X-Chromosome ตำแหน่ง HPRTB, DXS101, DXS7423 และ DXS8377 สามารถนำไปประยุกต์ใช้ในงานด้านนิติวิทยาศาสตร์ เกี่ยวกับการพิสูจน์บุคคลและการศึกษาเกี่ยวกับพันธุศาสตร์ประชากรได้

Mahidol University

Address: NAKHON PATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Worawee Waiyawuth

Role: Thesis Advisors

Created: 2006

Modified: 2025-05-19

Issued: 2010-06-02

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

ISBN: 9740472192

CallNumber: TH N194a 2006

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Forensic Science

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4436860.pdf	882.39 KB	10	2019-11-07 00:26:00

ใช้เวลา

0.2934 วินาที