Identification of dengue serotypes along the Thai-Laos border using the Nasba technique

การตรวจวินิจฉัยแยกซีโรไทป์ของเชื้อไวรัสไข้เลือดออกในเขตพื้นที่ชายแดนไทยลาวด้วยวิธี Nasba

Name: Sangchai Yingsakmongkon

MeSH: Dengue Virus

MeSH: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay

MeSH: Polymerase Chain Reaction

LCSH: Nucleotide sequence

Abstract: In this study, the detection of dengue serotypes was determined by NASBA technique. The samples were 402 probable DF/DHF patients and 171 students, aged 2-15 years and living in Nhong Kai, Nakhorn Phanom, and Mukdahan provinces. Data were collected from June to September 2002. The samples were tested by Combo Q Check test kit, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), polymerase chain reaction (PCR) and nucleic acid sequence-based amplification (NASBA). Statistical analyses used were descriptive statistics, Cochran’s Q test, McNemar test, and Kappa. Four serotypes of dengue virus were found in 2 provincial hospitals, except in Mukdahan Provincial Hospital, where only dengue virus serotype 2 was found. Mainly, dengue virus infections were due to dengue 2, by PCR and NASBA. There was excellent correlation in determination of dengue serotypes between PCR and NASBA (Cochran’s Q test, P = 0.065, N = 78), while the positive cases determined by ELISA were more than those determined by Combo Q Check test (McNemar test, P= 0.02, N=78). When compared to the PCR method, the sensitivities of NASBA by dengue 1-4 were 100, 100, 88.89, and 100%, respectively, while the specificities of NASBA by dengue 1-4 were 100, 99.32, 100, and 100%, respectively. For serotyping, NASBA showed similar specificity and sensitivity to PCR (κ= 0.97), was also rapid and used only a heating block and water bath. Therefore, the NASBA technique was more suitable in the field than PCR.

Abstract: การศึกษาครั้งนี้เพื่อตรวจวินิจฉัยหาซีโรไทป์ของเขื้อไข้เลือดออกและหาความไวและความจำเพาะของวิธี NASBA กลุ่มตัวอย่างเป็นคนป่วยที่สงสัยว่าเป็นโรคไข้เลือดออกจำนวน 402 คน และเด็กนักเรียนจำนวน 171 คน อายุอยู่ในช่วง 2-15 ปี ซึ่งอาศัยอยู่ในจังหวัดหนองคาย นครพนม และมุกดาหาร ทำการเก็บตัวอย่างในช่วงเดือนมิถุนายนถึงกันยายน พ.ศ.2545 ตัวอย่างที่ได้นำมาทำการทดสอบด้วยกัน 4 วิธี คือ ชุดตรวจ Combo Q Check, วิธี enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), วิธี polymerase chain reaction (PCR) และวิธี nucleic acid sequence-based amplification (NASBA) วิเคราะห์ข้อมูลทางสถิติโดยวิธีเชิงพรรณนา, วิธี Cochran’s Q, วิธี McNemar และ วิธี Kappa. ในการศึกษาครั้งนี้พบเชื้อไวรัสไข้เลือดออกทั้ง 4 ซีโรไทป์ในจังหวัดหนองคาย และนครพนม ยกเว้นในจังหวัดมุกดาหารที่พบเฉพาะซีโรไทป์ 2 โดยวิธี PCR และ NASBA พบว่ามีความสัมพันธ์กันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติระหว่างวิธี PCR และ NASBA (วิธี Cochran’s Q = 7.22, P = 0.065, N = 78) ระหว่างที่จำนวนผู้ป่วยที่ให้ผลบวกกับวิธี ELISA มากกว่า ผู้ป่วยที่ให้ผลบวกด้วยชุดตรวจ Combo Q Check อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ P= 0.02 วิธี NASBA เมื่อเปรียบเทียบกับวิธี PCR จำแนกแต่ละซีโรไทป์ (1-4) พบว่า มีความไวเท่ากับ 100, 100, 88.89 และ 100% ตามลำดับ ส่วนความจำเพาะของ NASBA เท่ากับ 100, 99.32, 100 และ100% ตามลำดับการหาซีโรไทป์ ความไว และ ความจำเพาะ ของ NASBA คล้ายคลึงกับ PCR (κ=0.97) ดังนั้นวิธี NASBA จึงเหมาะสมที่จะใช้ในพื้นที่มากว่า PCR เพราะรวดเร็วกว่าและใช้เพียง heating box และ waterbath เท่านั้น

Mahidol University

Address: NAKHON PATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Wipawee Usawattanakul

Role: Thesis Advisors

Created: 2004

Modified: 2553-04-27

Issued: 2010-02-02

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

ISBN: 9740445705

CallNumber: TH S225i 2004

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Tropical Medicine

Grantor: Mahidol University

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4437559.pdf	2.2 MB	27	2021-01-06 12:41:13

ใช้เวลา

0.294896 วินาที