การศึกษาแถบดีเอนเอเอนโดจีนัสรีโทรไวรัส (อีวี-21) ในไก่

Study of endogenous retrovirus (ev-21) DNA band in chicken

Name: จุฑารัตน์ จันทบูรณ์

Name: Jutarut Jantaboon

keyword: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยานิพนธ์. วท.ม. (พันธุวิศวกรรม) 2544

; ไก่ โรคลิวโคซิส การตรวจสอบทางพันธุกรรม

; ไก่ การตรวจหายีน

; ดีเอ็นเอ

; เอนโดจีนัสรีโทรไวรัส

Abstract: เอนโดจีนัสรีโทรไวรัส (endogenous retrovirus) ที่พบในจีโนมของไก่ (Gallus domfesticus) มีการเรียงตัวของลำดับเบสที่ใกล้เคียงกับเอเวียนลิวโคซิสในกลุ่มของรีโทรไวรัสในระดับสูง การพบแถบดีเอนเอเอนโดจีนัสรีโทรไวรัส มักเกี่ยวข้องกับความต้านทานของไก่ต่อการเกิดโรค การศึกษาครั้งนี้เพื่อใช้เทคนิค microsatellite และ CR1 markers ในการตรวจหาแถบดีเอนเอเอนโดจีนัสรีโทรไวรัน (อีวี-21) ในกลุ่มไก่พื้นเมือง และกลุ่มไก่เนื้อ รวม 72 ตัว โดยใช้ไพรเมอร์ที่ทำให้เกิดความหลากหลายของแถบดีเอนเอ และสามารถอธิบายผลการถ่ายทอดให้เป็นไปตามกฎของเมนเดล ดีเอนเอไก่เป็นรายตัวถูกนำมาตรวจหาความหลากหลาย โดยใช้ไพรเมอร์ USIL ที่เจาะจงกับตำแหน่ง อีวี-21 พบแถบดีเอนเอเกิดขึ้น 2 แถบ โดยมีค่าความถี่ของแถบดีเอนเอทั้ง 2 เท่ากับ 0.972, 0.928 และ 0.600, 0.400 ในไก่พื้นเมืองและในไก่เนื้อตามลำดับ นอกจากนี้ได้ใช้ไพรเมอร์ ADL117, ADL201 และ MSU70 ที่มีตำแหน่งอยู่บนโครโมโซม Z ที่เกี่ยวก้อยอยู่กับอีวี-21 และใช้ไพรเมอร์ ADL150, ADL160, ADL234 และ ADL252 ที่ทราบตำแหน่งบนโครโมโซมที่ 1 ของไก่ ศึกษาความแตกต่างของแถบดีเอนเอที่เกิดขึ้นในไก่ทั้ง 2 กลุ่ม พบความแตกต่างแถบดีเอนเออยู่ระหว่าง 2-4 อัลลิล ขึ้นกับไพรเมอร์ที่ใช้ ความที่อัลลิลที่แตกต่างระหว่างไก่ทั้ง 2 กลุ่ม อาจเป็นผลที่เกิดจากวิวัฒนาการของการคัดเลือกที่แตกต่างกันมาในอดีต แถบดีเอนเอที่เกิดขึ้นจะเป็นข้อมูลพื้นฐาน ในการศึกษาถึงเอนโดจีนัสรีโทรไวรัสที่มีอยู่ในไก่ต่อผลของการเกิดโรค และผลกระทบต่อลักษณะทางเศรษฐกิจต่อไปThe genome of the chicken, Gallus domesticus, contains endogenous retrovirus that displays base sequences of high similarity to Avain leukosis class of retroviruses. The presence of endogenous retrovirus DNA band is associated with disease resistance in chicken. This study had used microsatellite and CR1 markers techniques to investigate endogenous retrovirus (ev-21) DNA band of native and broiler chicken, with the total of 72 individuals. Primer was used to present polymorphic DNA bands and the results of inheritance could be explained following the Mendelian Law. The DNA was detected for polymorphic bands by using primer specific of USIL to ev-21 locus. The result indicated that DNA polymorphism was different between native and broiler chicken. It was found that 2 allele with frequency 0.972, 0.028 and 0.600, 0.400 in native and broiler chicken, respectively. By using primer ADL117, ADL201 and MSU70 linked with ev-21 locus on the chicken Z chromosome and using primer ADL150, ADL160, ADL234 and ADL252 which known location on chicken chromosome 1, the DNA pattern of 2-4 allele was observed depending on the primer used. It is likely that the genetic variation within the 2 groups of population was caused by the evolution by different selection. This difference of allele frequency can be used to study the effect of disease and economic trait on endogenous retrovirus in the future.

มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

Address: กรุงเทพมหานคร (Bangkok)

Name: วรวิทย์ สิริพลวัฒน์

Role: , ประธานกรรมการที่ปรึกษา

Created: 2544

Issued: 2548-09-21

Modified: 2548-09-21

วิทยานิพนธ์/Thesis

URL: http://www.lib.ku.ac.th/KUthesis/JutarutJan/index.html

ISBN: 974-462-109-5

CallNumber: SF995 .จ23

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: พันธุวิศวกรรม

Grantor: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

©copyrights มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	cert.pdf	31.84 KB	8	2018-05-14 08:21:25
2	tp.pdf	16.83 KB	7	2018-05-14 08:21:26
3	abst.pdf	87.07 KB	7	2018-05-14 08:21:27
4	ack.pdf	29.35 KB	7	2018-05-14 08:21:28
5	toc.pdf	56.31 KB	7	2018-05-14 08:21:29
6	chapter1.pdf	134.5 KB	12	2020-07-22 21:56:08
7	chapter2.pdf	736.67 KB	9	2018-05-14 08:21:31
8	chapter3.pdf	183.96 KB	9	2018-05-14 08:21:32
9	chapter4.pdf	1.65 MB	9	2018-05-14 08:21:33
10	chapter5.pdf	49.16 KB	8	2018-05-14 08:21:34
11	appdx.pdf	255.75 KB	7	2018-05-14 08:21:35
12	ref.pdf	273.12 KB	7	2018-05-14 08:21:36
13	JutarutJanAll.pdf	3.43 MB	8	2018-05-14 08:21:38

ใช้เวลา

0.057631 วินาที