การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของแตงไทย โดยเทคนิค RAPD และ TRAP

Biodiversity study of cucumis melo l. by using random amplified polymorphic dna (RAPD) and target region amplification polymorphism (TRAP) techniques

Name: แสงเดือน อินชนบท

keyword: แตงไทย

; RAPD

; TRAP

; การการปรับปรุงพันธุ์ปรับปรุงพันธุ์

Abstract: แตงกลุ่ม Cucumis melo (C. melo L.) เป็นพืชที่มีมูลค่าทางเศรษฐกิจเพิ่มมากขึ้น และมีความต้องการพันธุ์ที่มีรสชาติดีเหมือนแตงเมลอน ทนทานต่อโรค แมลง และสภาพอากาศ เหมือนแตงไทย งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ระหว่างเครื่องหมายโมเลกุลกับความหวานของแตงในกลุ่มนี้ด้วยเทคนิค Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) และเทคนิค Target Region Amplification Polymorphism (TRAP) โดยทำการศึกษาของลักษณะปรากฏ (phenotype) จำนวน 5 ลักษณะ ได้แก่ รูปร่างผล แถบบนผิว ผล สีผิว สีเนื้อ และลายตาข่าย ของแตงไทยจำนวน 12 ตัวอย่าง และแตงเมลอนจำนวน 5 ตัวอย่าง พบว่าสามารถจัดกลุ่มแตงไทยออกจากแตงเมลอนได้ และจากการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของกลุ่มแตงด้วยเทคนิค RAPD โดยใช้ไพรเมอร์จำนวน 9 ไพรเมอร์ พบแถบดีเอ็นเอทั้งหมด 48 แถบ เป็นแถบที่แสดงความหลากหลายทางพันธุกรรม จำนวน 44 แถบ คิดเป็น 91.6 เปอร์เซ็นต์ และแตงกลุ่ม C. melo มีค่าดัชนีความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.56 ถึง 1.0 จากการศึกษาด้วยเทคนิค TRAP พบไพรเมอร์จำนวน 59 คู่ ได้แถบดีเอ็นเอทั้งหมดจำนวน 379 แถบ เป็นแถบดีเอ็นเอที่แตกต่างระหว่างตัวอย่าง จำนวน 220 แถบ (58.05 เปอร์เซ็นต์) พบว่าแตงกลุ่ม C. melo มีค่าดัชนีความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.25 ถึง 0.88 และจากการศึกษาด้วยเทคนิค RAPD และ TRAP โดยใช้แถบดีเอ็นเอจากเทคนิค RAPD จำนวน 48 แถบ และเทคนิค TRAP จำนวน 379 แถบ พบแตงกลุ่ม C. melo มีค่าดัชนีความเหมือนอยู่ระหว่าง 0.23 ถึง 0.88 นอกจากนี้ทุกเทคนิคสามารถแบ่งกลุ่มแตง C. melo ได้เป็น 4 กลุ่มเช่นเดียวกัน จากการศึกษาความเชื่อมโยงของเครื่องหมายโมเลกุลที่ได้จากเทคนิค RAPD เทคนิค TRAP และผลรวมของ RAPD และ TRAP กับลักษณะความหวานพบว่าเครื่องหมายจากเทคนิค RAPD ด้วยวิธีแบบ 0,1 และ 1,2 มีเครื่องหมาย 14-5 ที่แสดงความเชื่อมโยงกับความหวาน โดยมีอิทธิพลกับความหวาน 77.80 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งได้จากการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอโดยไพรเมอร์ OP104 ส่วนการวิเคราะห์เครื่องหมายจากเทคนิค TRAP ด้วยวิธีแบบ 0,1 แสดงเครื่องหมาย X174 ที่เชื่อมโยงกับความหวาน โดยมีอิทธิพลกับความหวาน 87.07 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเป็น เครื่องหมายที่ได้จากการเพิ่มจำนวนของไพรเมอร์ Neutral invertase1 กับ Sa17-800 ในขณะที่การวิเคราะห์ด้วยวิธีแบบ 1,2 พบเครื่องหมาย X41 ที่เชื่อมโยงกับความหวาน โดยมีอิทธิพลกับความหวาน 87.07 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเป็นเครื่องหมายที่ได้จากการเพิ่มจำนวนของไพรเมอร์ Su-P-syk1 กับ Odd15-700 และการศึกษาเครื่องหมายที่ได้จากเทคนิค RAPD และ TRAP ด้วยวิธีแบบ 0,1 พบเครื่องหมาย W7-1 ที่เชื่อมโยงกับความหวาน โดยมีอิทธิพลกับความหวาน 87.07 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเป็นเครื่องหมายที่ได้จากการเพิ่มจำนวนของไพรเมอร์ OPW07 ในขณะที่ด้วยวิธีแบบ 1,2 พบเครื่องหมาย X41 ที่เชื่อมโยงกับความหวาน โดยมีอิทธิพลกับความหวาน 87.07 เปอร์เซ็นต์ โดยที่เครื่องหมาย 14-5, X174 และ W7-1 เป็นแถบดีเอ็นเอที่ปรากฏในกลุ่มแตงไทยที่มีความหวานต่ำในขณะที่เครื่องหมาย X41 จะเป็นแถบดีเอ็นเอที่ปรากฏในกลุ่มแตงเมลอนที่มีความหวานสูง ดังนั้นเครื่องหมาย X41 จึงน่าจะเป็นเครื่องหมายที่สามารถนำไปใช้ในการปรับปรุงพันธุ์แตงไทยในลักษณะความหวานต่อไป

Abstract: Cucumis melo (C. melo L.) group is an important crop with increasing economic value. The improvement of the varieties with great taste like melon and resistance to insects and unfavorable weather conditions similar to Thai melon has been needed. This research aimed to study genetic diversity and the relationship between molecular markers and the sweetness trait of C. melo L. by using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Target Region Amplified Polymorphism (TRAP) techniques. Five traits: fruit shape, fruit stripes, skin color, flesh color, and netting were studied in 12 accessions of Thai melon and 5 accessions of melon. The dendrogram results showed that Thai melon can be distinguished from melon. Results of the RAPD technique using nine primers showed that 48 DNA bands were amplified, of which 44 bands (91.67%) were polymorphic bands. The similarity index of C. melo L. ranged from 0.56 to 1.00. Results of the TRAP technique showed that 59 pairs of primers were able to amplify a total of 379 DNA bands, of which 220 bands (58.05%) were polymorphic bands. The similarity index of C. melo L. ranged from 0.25 to 0.88. When using 48 bands from the RAPD technique and 379 bands from the TRAP technique, the similarity index of C. melo L. ranged from 0.23 to 0.88. Moreover, C. melo L. was classified into 4 groups using all techniques. The relationship between molecular markers from RAPD, TRAP, and the combination of RAPD and TRAP with the sweetness trait was studied. The 0,1 and 1,2 analysis of markers from the RAPD technique showed that the 14-5 marker was correlated with sweetness at 77.80 percent. This marker was generated from DNA amplification of the OP104 primer. The 0,1 analysis of markers from the TRAP technique showed that the X174 marker was correlated with sweetness at 87.07 percent, which was generated from amplification of Neutral invertase1 and Sa17-800 primers. Whereas the 1,2 analysis of markers from the TRAP technique showed that the X41 marker was correlated with sweetness at 87.07 percent, which resulted from the use of Su-P-syn1 and Odd15-700 primers. Moreover, the 0,1 analysis of markers from the RAPD and TRAP techniques showed that the W7-1 marker was correlated with sweetness at 87.07 percent, which was generated from the OPW07 primer. Whereas the 1,2 analysis of markers from RAPD and TRAP techniques showed that the X41 marker was correlated with sweetness at 87.07 percent. However, the markers 14-5, X174, and W7-1 were found in the Thai melon group with low sweetness, while the marker X41 was found in the melon group with high sweetness. Therefore, marker X41 may be used for the high-sweetness trait in Thai melon breeding programs.

มหาวิทยาลัยแม่โจ้. สำนักหอสมุด

Address: เชียงใหม่

Email: mjudc@mju.ac.th

Name: แสงทอง พงษ์เจริญกิต

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาหลัก

Name: ช่อทิพา สกูลสิงหาโรจน์

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาร่วม

Name: วราภรณ์ แสงทอง

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาร่วม

Created: 2018

Modified: 2568-10-12

Issued: 2568-08-06

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

Th

tha

DegreeName: ปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาพันธุศาสตร์

Level: ปริญญาเอก

Descipline: สาขาวิชาพันธุศาสตร์

Grantor: Maejo University

©copyrights มหาวิทยาลัยแม่โจ้

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	fulltext.pdf.PDF	3.62 MB

ใช้เวลา

0.05447 วินาที