การตรวจคุณลักษณะและสารต้านอนุมูลอิสระของ Streptomyces ใหม่ สายพันธุ์ AA8

Characterization and antioxidant compounds of novel Streptomyces sp. strain AA8

Name: อรณิชา ธยานุวัฒนวงศ์

ThaSH: แอคติโนมัยซิส

ThaSH: สเตรปโตมัยซิส

ThaSH: โครมาโตกราฟี

ThaSH: แอนติออกซิแดนท์

LCSH: Streptomyces

LCSH: Antioxidants

LCSH: Chromatographic analysis

LCSH: Actinomyces

Abstract: แอคติโนมัยสีทไอโซเลต AA8 ซึ่งแยกได้จากตัวอย่างดินที่เก็บจากสวนผลไม้ในจังหวัดกรุงเทพมหานครได้ถูกระบุชนิดโดยการศึกษาอนุกรมวิธานหลายส่วน ผลการศึกษาแสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์ AA8 เป็นสมาชิกของสกุล Streptomyces และมีความสัมพันธ์ใกล้เคียงกับ Streptomyces roseifaciens DSM 106196T ที่ระดับความคล้ายคลึงของยีนช่วง 16S rRNA สูงสุดที่ 99.9 เปอร์เซ็นต์ การระบุชนิดด้วยข้อมูลจีโนมแสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์ AA8 มีความสัมพันธ์ใกล้เคียงกับ Streptomyces roseifaciens DSM 106196T และมีค่า ANI ในระดับต่ำ (94.1 เปอร์เซ็นต์) การวิเคราะห์จีโนมด้วยแพลตฟอร์ม antiSMASH พบว่าสายพันธุ์ AA8 ประกอบไปด้วยกลุ่มยีนสำหรับชีวสังเคาระห์สารทุติยภูมิ หลายกลุ่มยีน ได้แก่ กลุ่มยีนโพลีคีไทด์ซินเทสชนิดที่ 1 และ 3 กลุ่มยีนสำหรับชีวสังเคราะห์เทอร์ปีน กลุ่มยีนนัน-ไรโบโซมอลเปบไทด์ซินทีเทสและกลุ่มยีนที่คล้ายกับนัน-ไรโบโซมอลเปบไทด์ซินทีเทส สารสกัดหยาบของสายพันธุ์ AA8 แสดงฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระที่ระดับ IC₅₀ 7.03 ± 0.02 มิลลิกรัมต่อมิลลิลิตร ดังนั้นการตรวจสอบคุณลักษณะทางเคมีจึงถูกดำเนินการควบคู่กับวิธีการทดสอบฤทธิ์ทางชีวภาพและนำไปสู่การแยกสารบริสุทธิ์จำนวน 9 สาร ได้แก่ สาร 3,4-dimethoxypropiophenone (A), 6,7,8-Trimethoxy-3 - methylisocoumarin (B), 3 , 4 - dimethoxybenzamide (C), 6 , 8 - dimethoxy-3 -methylisocoumarin (D), 4-hydroxy-3-methoxybenzamide (E), 3,4-dihydroxybenzaldehyde (F), Nb-acetyltryptamine (G), 3-Hydroxymethyl-6 ,7 ,8-trimethoxyisocoumarin (H), 1 - methoxy-1H-pyrrole-2-carboxamide (I) สารที่แยกได้เหล่านี้ถูกประเมินฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระ พบว่า ทุกสารแสดงฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระได้ในช่วง IC₅₀ 0.87–384.85 มิลลิกรัมต่อมิลลิลิตร นอกจากนี้สาร 3,4-dihydroxybenzaldehyde และ 6,7,8-trimethoxy-3-methylisocoumarin มีฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระได้ดีแสดงให้เห็นว่าเป็นสารต้านอนุมูลอิสระที่มีศักยภาพ

Abstract: An actinomycete, designated strain AA8, isolated from soil collected from the orchard in Bangkok province, was identified using a polyphasic taxonomic approach. The result showed that strain AA8 was a member of the genus Streptomyces and was closely related to Streptomyces roseifaciens DSM 1 0 6 1 9 6 T with the highest 16S rRNA gene sequence similarity (99.9 %). Genomic-based identification revealed strain AA8 was most closely related to Streptomyces roseifaciens DSM 106196T and shared the low values of average nucleotide identity (ANI) (94.1%). Genome analysis by antiSMASH platform revealed that strain AA8 contained several secondary metabolite biosynthetic gene clusters (smBGCs) i.e. type I and III polyketide synthase gene clusters, terpene biosynthesis gene clusters, non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) gene clusters, and NRPS-like gene clusters. The crude extract of strain AA8 exhibited antioxidant activity at IC₅₀ 7.03 ± 0.02 mg/ml. Therefore, the chemical investigation was conducted by employing bioassayguided method and led to the isolation of 9 pure compounds, including 3,4-dimethoxypropiophenone (A), 6,7,8-trimethoxy-3-methylisocoumarin (B), 3, 4-dimethoxybenzamide (C), 6,8-dimethoxy-3-methylisocoumarin (D), 4-hydroxy-3-methoxybenzamide (E), 3,4-dihydroxybenzaldehyde (F), Nb- acetyltryptamine (G), 3-Hydroxymethyl-6,7,8-trimethoxyisocoumarin (H), 1-methoxy-1H-pyrrole-2-carboxamide (I). These isolated compounds were evaluated for antioxidant activity. All compounds exhibited antioxidant activity in the range of IC₅₀ 0.87–384.85 mg/ml. Besides, compounds 3,4-dihydroxybenzaldehyde and 6,7,8- trimethoxy-3-methylisocoumarin displayed strong antioxidant activity, indicating a potential for antioxidant agents.

สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง. สำนักหอสมุดกลาง

Address: กรุงเทพมหานคร

Email: Lifelong@kmitl.ac.th

Name: จิตติ ท่าไว

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์

Email : chitti.th@kmitl.ac.th

Name: ปัทมา พิทยขจรวุฒิ

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์ร่วม

Created: 2564

Modified: 2564-12-04

Issued: 2564-12-04

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: เทคโนโลยีชีวภาพ

Grantor: สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง

©copyrights สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	Fulltext Onnicha Thayanuwadtanawong.pdf	7.37 MB	3	2022-01-09 20:03:37

ใช้เวลา

0.035045 วินาที