การวิเคราะห์ association mapping ระหว่างเครื่องหมาย intron length polymorphism กับลักษณะลำต้นในอ้อย

Association mapping of intron length polymorphism markers for stalk traits in sugarcane

Name: พัชรี หมื่นอินกูด

keyword: เครื่องหมายไอแอลพี

; ลักษณะลำต้น

; อ้อย

Abstract: การคัดเลือกพันธุ์โดยใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอ (marker assisted selection) เป็นวิธีที่ช่วยเพิ่มความแม่นยำในการคัดเลือกและลดระยะเวลาในโครงการปรับปรุงพันธุ์อ้อยได้ งานวิจัยนี้ได้พัฒนาเครื่องหมาย Intron Length Polymorphism (ILP) จากยีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตทางลำต้นจำนวน 32 ยีน วิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่างเครื่องหมายดีเอ็นเอกับลักษณะลำต้นของอ้อยที่มีความหลากหลายทางพันธุกรรมจำนวน 200 พันธุ์ ด้วยวิธี association mapping เครื่องหมาย ILP แสดงแอลลีลที่แสดงความแตกต่างได้ 129 แอลลีล จากยีน 32 ยีน มีค่า polymorphism information content (PIC) เฉลี่ย 0.27 การวิเคราะห์โครงสร้างทางพันธุกรรม พบว่าตัวอย่างอ้อยแบ่งออกเป็น 5 ประชากรย่อย โดยมีค่า FST เท่ากับ 0.12 บ่งชี้ว่าการแลกเปลี่ยนเชื้อพันธุกรรมอ้อยระหว่างโครงการปรับปรุงพันธุ์อ้อยทั่วโลกส่งผลให้พันธุ์อ้อยในปัจจุบันไม่มีความแตกต่างกันมากนัก การวิเคราะห์ association mapping ด้วยโมเดลทดสอบแบบ mixed linear model (MLM) พบเครื่องหมาย SILP208-1 (Class III HD-Zip) และ SILP100-1 (E3 ubiquitin-protein ligase Bre1) ที่มีความสัมพันธ์อย่างมากกับลักษณะความสูง และเครื่องหมาย SILP80-1 (Lax panicle2) และ SILP153-2 (Gretchen Hagen3-8) ที่มีความสัมพันธ์กับขนาดลำของอ้อย โดยอธิบายความแปรปรวนของลักษณะที่ปรากฏได้ 5.3-6.3 % ผลการศึกษาครั้งนี้จะเป็นประโยชน์ในการนำเครื่องหมายดีเอ็นเอมาใช้คัดเลือกพันธุ์อ้อยที่มีลักษณะลำต้นที่ดีและให้ผลผลิตสูงในโครงการการปรับปรุงพันธุ์อ้อยต่อไป

มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์. หอสมุดแห่งมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์

Address: กรุงเทพมหานคร

Email: preserv@tu.ac.th

Name: กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ

Role: อาจารย์ที่ปรึกษา

Created: 2560

Modified: 2564-04-29

Issued: 2564-04-29

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

DOI: 10.14457/TU.the.2017.42

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: เทคโนโลยีชีวภาพ

Grantor: มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์

©copyrights มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	3174patcharee.pdf	1.98 MB

ใช้เวลา

0.030482 วินาที