แจ้งเอกสารไม่ครบถ้วน, ไม่ตรงกับชื่อเรื่อง หรือมีข้อผิดพลาดเกี่ยวกับเอกสาร ติดต่อที่นี่ ==>
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
ปวิตา ทิพย์สมบัติกุล. Development of the Cassava EST Database System and Its Application. Master's Degree(Bioinformatics). King Mongkut's University of Technology Thonburi. KMUTT Library.. : King Mongkut's University of Technology Thonburi, 2007.
Development of the Cassava EST Database System and Its Application
การพัฒนาระบบฐานข้อมูลอีเอสทีของมันสำปะหลังและการประยุกต์ใช้
Name: Pavita Tipsombatboon
Name: ปวิตา ทิพย์สมบัติกุล
keyword:
Cassava
Abstract:
Cassava (Manihot esculenta Crantz) is the third most important crop in Thailand that gives the highest yield of food energy and traded internationally in several different
forms - most notably is starch. A genomic approach is now a critical step for further research and development in cassava biotechnology, including starch metabolism. To gain an
insight understanding of the starch biosynthesis, the expressed sequence tags (ESTs) from 14 independent cDNA libraries prepared from different environmental conditions
(a collaboration between BIOTEC, Thailand and NAIST, Japan) are deposited in the developed cassava EST database. ESTs will fulfill information on general cassava biology,
including its development and starch metabolism. The cassava EST database contains 100,000 ESTs, which are cleaned and assembled into 10,632 contigs and10,513 singletons.
Due to the vast size of this information, the cassava EST database was developed to systematically store and efficiently manage information that provides a useful genetic
resource as user-friendly web interface. It provides integrated access to ESTs from the cassava (Manihot esculenta Crantz), which will facilitate identification of a number of
genes, development genetic markers and comprehensive cloning of gene families of interest for scientific community. Users can retrieve information using text or blast searches.
Annotation is provided against NCBI, Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Solanum lycopersicum, Solanum tuberosum and Medicago truncatula EST databases, and with GO
vocabulary. This work can be contributed to the study of cassava transcription profiles under different environmental and developmental conditions.
Abstract:
มันสำปะหลัง (Manihot esculenta Crantz) เป็นพืชที่สำคัญเป็นลำดับสามของประเทศไทยที่ให้ผลิตผลทางอาหารสูงที่สุด และเป็นสินค้าออกไปยังต่างประเทศในหลากหลาย
รูปแบบ โดยเฉพาะแป้งมันสำปะหลัง การศึกษาจีโนมเป็นอีกก้าวสำคัญ เพื่อพัฒนาการศึกษาชีววิทยาของมันสำปะหลังใหม่ รวมถึงการศึกษาเมตาบอลิซึ่มของแป้ง ได้มีการ
เตรียมอีเอสทีจาก 14 ไลบรารี่ ด้วยเงื่อนไขสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันด้วยความร่วมมือของ BIOTEC ประเทศไทยและ NAIST ประเทศญี่ปุ่น โดยข้อมูลถูกเก็บไว้ในฐานข้อมูล
อีเอสทีของมันสำปะหลังที่สร้างขึ้น ลำดับเบสของอีเอสทีซึ่งเป็นข้อมูลสารสนเทศจึงง่ายในการนำมาศึกษาทางชีววิทยาของมันสำปะหลังการเจริญเติบโตของมันสำปะหลัง
และเมตาบอลิซึ่มของแป้งด้วย ฐานข้อมูลอีเอสทีของมันสำปะหลังประกอบด้วย 100,000 อีเอสที หลังจากการคัดออก ได้มีการรวบรวมเป็น 10632 คอนทิค และ 10513
ซิงเกิลตอน เนื่องด้วยข้อมูลที่มีขนาดใหญ่ ระบบฐานข้อมูลอีเอสทีของมันสำปะหลังจึงถูกพัฒนาขึ้นเพื่อจัดเก็บอย่างเป็นระบบและจัดการข้อมูลอย่างมีประสิทธิภาพ ด้วยเว็บ
อินเตอร์เฟซที่ใช้งานง่าย สามารถเข้าถึงอีเอสทีของมันสำปะหลัง ที่ซึ่งช่วยให้การระบุจำนวนยีน การพัฒนาเครื่องหมาย ทางพันธุศาสตร์ และการทำสำเนาอย่างครอบคลุมของ
ยีนในตระกลูเดียวกันที่น่าสนใจของกลุ่มนักวิทยาศาสตร์ ผู้ใช้สามารถดึงเอาข้อมูลออกมาโดยใช้การค้นหาด้วยข้อความ หรือการบลาซ การให้คำจำกัดความอีเอสทีของ
มันสำปะหลังถูกจัดหาด้วย NCBI, กลุ่มคำศัพท์ของ GO และ นำไปเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลอีเอสทีของ Arabidopsis thaliana, Oryza sativa, Solanum lycopersicum, Solanum
tuberosum, Medicago truncatula ฐานข้อมูลอีเอสทีของมันสำปะหลัง มีส่วนช่วยในการศึกษาโครงร่างการถอดรหัสของมันสำปะหลังภายใต้สภาพแวดล้อมและเงื่อนไขของการ
พัฒนาที่แตกต่างกัน
King Mongkut's University of Technology Thonburi. KMUTT Library.
Address:
BANGKOK
Email:
info.lib@mail.kmutt.ac.th
Name: Supapon Cheevadhanarak
Role:
Advisor
Created:
2007
Modified:
2012-02-07
Issued:
2010-06-29
วิทยานิพนธ์/Thesis
application/pdf
CallNumber:
BIF47
eng
DegreeName: Master of Science
Level: Master's Degree
Descipline: Bioinformatics
©copyrights King Mongkut's University of Technology Thonburi
RightsAccess:
ใช้เวลา
0.041356 วินาที
Pavita Tipsombatboon
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| Development of the Cassava EST Database System and Its Application
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี Pavita Tipsombatboon;ปวิตา ทิพย์สมบัติกุล | Supapon Cheevadhanarak | วิทยานิพนธ์/Thesis |
ปวิตา ทิพย์สมบัติกุล
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| Development of the Cassava EST Database System and Its Application
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี Pavita Tipsombatboon;ปวิตา ทิพย์สมบัติกุล | Supapon Cheevadhanarak | วิทยานิพนธ์/Thesis |
Supapon Cheevadhanarak