แจ้งเอกสารไม่ครบถ้วน, ไม่ตรงกับชื่อเรื่อง หรือมีข้อผิดพลาดเกี่ยวกับเอกสาร ติดต่อที่นี่ ==>
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
Supat Thongjuea. Expert System for Positional Candidate Gene Mining in Oryza Genome: Phase I, Datawarehouse Construction. Master's Degree(Bioinformatics). King Mongkut's University of Technology Thonburi. KMUTT Library.. : King Mongkut's University of Technology Thonburi, 2005.
Expert System for Positional Candidate Gene Mining in Oryza Genome: Phase I, Datawarehouse Construction
Name: Supat Thongjuea
Abstract:
After the completion of the rice genome, many publicly useful biological data are
released. Especially, the high-throughput technologies such as microarray, proteomics
and gene-tagging approaches are greatly increasing the volume of information to assist
genes function identification. Most of these biological data are published on the public
domain databases, which are the target of scientists to apply bioinformatics approaches
and data integration systems to find the most promising candidate genes and function of
genes. To utilize heterogeneous rice biological data analyzing for selection the genes of
interest, "RiceGeneThresher", a bioinformatics tool for mining rice biological data, was
developed. RiceGeneThresher consolidates the rice genetics information, genome
annotation, transcriptome, proteome, and metabolome, from the rice biological
information on the public domains. Its system provides a generic datawarehousing
solution for fast and flexible querying rice biological data sets and integration with
third-party data and tools. Its database design and its application interfaces provide a
powerful, flexible tool for the delivery of customized set of rice biological data.
RiceGeneThresher be able to generate supported evidences from each type of "omics"
information that are essential for analyzing and targeting groups or networks of genes
for the interested traits underlying QTLs. This bioinformatic tool is special design for
the rice breeders and rice molecular biologists. However, users ranging from breeders,
laboratory researchers to the experienced molecular biologists and bioinformaticians
can use it in a wide variety of application and scenario to discover and assign the most
promising candidate genes preparation for the further gene functional analysis to
improve the rice cultivars.
Abstract:
หลังจากการถอดรหัสดีเอ็นเอของจีโนมข้าวสิ้นสุดลง ข้อมูลในหลาย ๆ ด้านที่เกี่ยวข้องกับการค้นหา
หน้าที่ของยีนได้ถูกเปิดเผยเป็นข้อมูลสาธารณะเช่นข้อมูล microarray ข้อมูล proteomics และ
ข้อมูลจากวิธีการ gene-tagging ที่กำลังมีมากเพิ่มขึ้นทำให้การค้นหาหน้าที่ของยีนมีประสิทธิภาพ
และความแม่นยำ ส่วนใหญ่ข้อมูลเหล่านี้จะถูกประกาศเป็นข้อมูลสาธารณะและเก็บรวบรวมเป็น
ฐานข้อมูลเฉพาะสำหรับข้อมูลนั้น ๆ ซึ่งเป็นแหล่งความรู้ที่เป็นเป้าหมายของนักวิทยาศาสตร์ที่จะใช้
วิธีการต่าง ๆ ไปประยุกต์ใช้และรวบรวมข้อมูลเหล่านี้สำหรับการค้นหายีนเป้าหมาย เพื่อที่จะใช้
ประโยชน์จากข้อมูลต่างชนิดกันสำหรับค้นหายีนเป้าหมาย ''RiceGeneThresher" คือเครื่องมือ
ทางด้านไบโออินเฟอร์เมติกส์ที่ได้ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อค้นหายีน "RiceGeneThresher" ได้รวบรวม
ข้อมูลทางด้าน geneic, transcriptome, proteome และ metabolic pathways จากฐานข้อมูล
สาธารณะ ระบบได้ถูกพัฒนาให้มีความสามารถในการสืบค้นและรวบรวมข้อมูลซึ่งทำงานอยู่บน
ระบบฐานข้อมูลแบบ "datawarehousing" ระบบฐานข้อมูลและซอฟแวร์ที่ติดต่อกับผู้ใช้ ถูกสร้าง
ให้มีสมรรถภาพและมีความเหมาะสมต่อการใช้ข้อมูลแต่ละชนิด "RiceGeneThresher" สามารถที่
จะวิเคราะห์ ข้อมูลโดยใช้การอ้างอิงแหล่งที่มาของข้อมูล "omics" และหลักฐานประกอบต่าง ๆ เพื่อ
ช่วยในการวิเคราะห์และค้นหายีนเป้าหมายของแต่ละลักษณะที่สนใจซึ่งอยู่ในช่วง QTL นั้น ๆ
เครื่องมือชิ้นนี้ถูกออกแบบมาเพื่อช่วยนักปรับปรุงพันธุ์ข้าวและนักชีวโมเลกุลในการค้นหายีน
อย่างไรก็ตามผู้ใช้จากสาขาต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องไม่ว่าจะเป็นนักปรับปรุงพันธุ์ข้าว นักวิจัย นักชีวโมเลกุล
รวมไปถึงนักไบโออินฟอร์เมติกส์ สามารถใช้เครื่องมือนี้เพื่อช่วยในการค้นหายีนที่สนใจ และนำยีน
เหล่านี้ไปค้นหาหน้าที่ที่แท้จริงด้วยวิธีการอื่น ๆ ต่อไป
King Mongkut's University of Technology Thonburi. KMUTT Library.
Address:
BANGKOK
Email:
info.lib@mail.kmutt.ac.th
Name: Apichart Vanavichit
Role:
Advisor
Created:
2005
Modified:
2012-02-07
Issued:
2010-06-20
วิทยานิพนธ์/Thesis
application/pdf
CallNumber:
BIF25
eng
DegreeName: Master of Science
Level: Master's Degree
Descipline: Bioinformatics
©copyrights King Mongkut's University of Technology Thonburi
RightsAccess:
ใช้เวลา
0.033115 วินาที
Supat Thongjuea
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| Expert System for Positional Candidate Gene Mining in Oryza Genome: Phase I, Datawarehouse Construction
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี Supat Thongjuea | Apichart Vanavichit | วิทยานิพนธ์/Thesis |
Apichart Vanavichit