การแยกยีน nonribosomal peptide synthetase จาก Xylaria sp.BCC 1067

Identification of a nonribosomal peptide synthetase gene from Xylaria sp. BCC1067

Name: จิราภรณ์ จิรัคคกุล

Organization : มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. คณะทรัพยากรชีวภาพและเทคโนโลยี. สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ

keyword: Bioactive Compounds

; สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ

; การโคลนยีน

; Molecular Cloning

Abstract: The fungi in Xylariaceae are rich sources of novel bioactive compounds of possible pharmaceutical interest.Many of them are active peptides that are synthesized by conribosomal peptide synthetases (NRPSs). In the present work, a NRPS gene of Xylaria sp. BCC 1067 was isolated by screening the genomic DNA library of Xylaria sp. BCC 1067 with a homologous probe, and designated as nrpsxy. The nucleotide sequence of nrpsxy was revealed to contain a single open reading frame of 10,641 bp, interrupted by 1 intron of 61 bp, encoding 3,546 amino acid residues. In the proximity of nrpsxy, a second gene with high similarity to an efflux pump was identified and named as e&. The genetic architecture and domain organization of the nrpsxy suggest that it is an iterative NRPS, comprising of two complete elongation modules. Their active domains are organized in the following order: Condensation, Adenylation, Thiolation, Condensation, Adenylation, N-Methylation, Thiolation, Thiolation, Condensation and Reductase domain (C-A-TC-A-M-T-T-C-R). Its domain organizations resemble those of the enzymes in cyclodepsipeptide synthetase group, particularly, with highest similarity (74%) to enniatin synthetase. However, the study of precursor-directed biosynthesis technique, demonstrated that XyIaria sp. BCC 1067 could not produce enniatin at the condition tested, implying that nrpsxy might not involve in the synthesis of enniatin. Gene inactivation by selectable marker-assisted mutation and metabolite profiling analyses by HPLC were also carried out, to further determine the functional property of nrpsxy. The result revealed a mutant incapable of producing a product at the retention time of 51.15 minutes,when compared to metabolite profiles of the wild type, indicating that it is the product of nrpsxy. Taken all together, it could be speculated that nlpsxy is a member of yclodepsipeptide synthetases with high potentials in producing natural products of biological activity importance, for which its clear function has to be further elucidated. This is the first report of the cloning and characterization of a NRPS gene from a fungus in Xylariaceae.

มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. สำนักหอสมุด

Address: กรุงเทพมหานคร (Bangkok)

Email: info.lib@mail.kmutt.ac.th

Name: สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์

Role: อาจารย์ที่ปรึกษา

Name: จันทิรา ปัญญา

Role: อาจารย์ที่ปรึกษา

Created: 2547

Issued: 2007-06-15

Modified: 2007-07-20

วิทยานิพนธ์/Thesis

ISBN: 9741841833

CallNumber: BIT504

tha

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: เทคโนโลยีชีวภาพ

Grantor: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี

©copyrights มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	BIT504.pdf	5.04 MB	37	2019-07-29 13:49:36
2	BIT504ab.pdf	92.16 KB	10	2019-07-29 13:49:54
3	BIT504.txt	2.52 KB	13	2020-12-07 15:36:29

ใช้เวลา

0.037752 วินาที