การพัฒนาเครื่องหมายสนิปส์สําหรับลักษณะต้านทานเชื้อรา Phytophthora capsici ในพริก

Development of the single nucleotide polymorphism markers for Phytophthora capsici resistance in Capsicum annuum

Name: น้ำฝน จอมแก้ว

keyword: เชื้อราก่อโรคต่อพืช

LCSH: Phytophthora

Classification :.: 633.84

; P capsici

ThaSH: มหาวิทยาลัยแม่โจ้ -- วิทยานิพนธ์

; สนิปส์

ThaSH: พริก

ThaSH: พืชกับเชื้อรา

ThaSH: เชื้อราในการเกษตร

Abstract: เชื้อรา Phytophthora capsici Leonian (P. capsici) เป็นเชื้อก่อโรคที่สําคัญในการผลิตพริก (Capsicum annuum) ในการศึกษานี้ได้ใช้เทคนิค bulked segregant analysis (BSA) ร่วมกับเครื่องหมายโมเลกุลชนิดสนิปส์เพื่อติดตามหา quantitative trait loci (QTL) ที่ควบคุม ลักษณะต้านทานเชื้อรา P. capsici ในกลุ่มประชากร double haploid (DIH) ที่มาจากการผสม ระหว่างพันธุ์ที่มีความต้านทานต่อเชื้อรา P capsici คือ สายพันธุ์ Criollo de Morelos - 334 (CM-334) กับพันธุ์ที่มีความอ่อนแอต่อเชื้อรา P capsici คือ สายพันธุ์ Jindu โดยสามารถคัดเลือก ไพรเมอร์สนิปส์ที่แสดงความแตกต่างระหว่างกลุ่มต้านทานและกลุ่มอ่อนแอต่อเชื้อรา P. capsici ได้จํานวน 45 ไพรเมอร์ จากไพรเมอร์ที่ได้จากฐานข้อมูลพริกจํานวน 1,036 ไพรเมอร์ แล้วนําสนิปส์ทั้ง 45 ไพรเมอร์ ตรวจสอบจีโนไทป์ในประชากร DH จากนั้นดําเนินการสร้างแผนที่พันธุกรรม (linkage maps) และวิเคราะห์หา QIL โดยพบตําแหน่ง QTL ที่คะแนน logarithm of odd ratio (LOD) สูงที่สุดอยู่ที่โครโมโซมแท่งที่ 5 โดยมีคะแนนเป็น 11 และสามารถอธิบายความ แปรปรวนของเปอร์เซ็นต์ความต้านทานได้ 31 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเป็น QTL หลัก เหมือนกับที่มีรายงานมาก่อนหน้านี้และตรวจพบ (QIL บนโครโมโซมแท่งที่ 8 ด้วยคะแนน LOD เป็น 3.36 โดยสามารถอธิบายความแปรปรวนของเปอร์เซ็นต์ความต้านทานได้ 11.9 เปอร์เซ็นต์ เป็น QTL รอง พบ การศึกษานี้เป็นครั้งแรก โดยใน QTL หลักและ QTL รองมีเครื่องหมายโมเลกุลแบบสนิปส์ที่อยู่ใกล้ คือ SNP 421 และ SNP 694 ตามลําดับ เครื่องหมายโมเลกุลแบบสนิปส์ทั้งสองจึงเป็นเครื่องหมายโมเลกุลที่อยู่ใกล้กับตําแหน่ง QTL ที่ต้านทานเชื้อรา P. capsici

มหาวิทยาลัยแม่โจ้. สำนักหอสมุด

Address: เชียงใหม่

Email: mjudc@mju.ac.th

Name: แสงทอง พงษ์เจริญกิต

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาหลัก

Name: วราภรณ์ แสงทอง

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาร่วม

Name: ช่อทิพา สกูลสิงหาโรจน์

Role: อาจารย์ที่ปรึกษาร่วม

Name: ช่อทิพา สกูลสิงหาโรจน์

Role: ประธานอาจารย์ประจำหลักสูตร

Created: 2558

Issued: 2018-06-10

Modified: 2561-06-14

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

CallNumber: Th 633.84 น525ก

tha

Spatial: ไทย

DegreeName: วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต

Level: ปริญญาโท

Descipline: พันธุศาสตร์

Grantor: มหาวิทยาลัยแม่โจ้

©copyrights มหาวิทยาลัยแม่โจ้

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	fulltext.pdf	29.17 MB	3	2021-04-11 18:53:56
2	abstract.pdf	842.24 KB	1	2018-07-30 14:03:31

ใช้เวลา

0.033817 วินาที