Hyperpolymorphic short tandem repetitive DNA stability in decomposed human tissues

การศึกษาความคงตัวของ Short Tandem Repeat DNA ในเนื้อเยื่อมนุษย์ที่ผ่านกระบวนการเน่าตามธรรมชาติ

Name: Apichaya Hiranphoonyaphreeda

LCSH: Dead -- Identification

LCSH: DNA -- Stability

MeSH: Microsatellite Repeats

Abstract: A sample of highly degraded DNA or low copy number in a sample presents a challenge for forensic science work. Improving the quantity and quality of a sample would greatly increase the STR profiling success. The important procedures in DNA analysis methods are extraction and polymerase chain reaction amplification. In this study, fifteen short tandem repeat loci and amelogenin were used to investigate DNA profiles in decomposed human tissue. Four extraction methods, phenolchloroform, Chelex extraction, silica-base method (QIAamp®DNA Micro Kits) and MasterPure™ Complete DNA purification kits that can not recover DNA yield enough for amplification successful because there are many factors from samples that lead to PCR-based typing fail are in the highly degraded period. Particularly DNA destroying enzymes digested DNA into too small fragment that were too small and too difficult to amplify for analysis. In this case should be selected more sensitive technique need to investigate LCN DNA profiles such as mini-STR and single nucleotide polymorphism (SNP) technique for solving problems from severely degraded samples

Abstract: การตรวจพิสูจน์บุคคล (Human Identification) และการตรวจพิสูจน์วัตถุพยานชีวภาพในทางนิติวิทยาศาสตร์นั้นมักจะเกี่ยวข้องกับการตรวจวิเคราะห์เปรียบเทียบสารพันธุกรรม แต่ปัญหาที่สำคัญในการตรวจวิเคราะห์เปรียบเทียบสารพันธุกรรมนั้นก็คือ การเสื่อมสลายของสารพันธุกรรม ส่งผลให้การตรวจเปรียบเทียบเป็นไปได้ยาก ทั้งปริมาณและคุณภาพของตัวอย่างจึงเป็นปัจจัยสำคัญ ดังนั้นการศึกษากับความคงตัวของสารพันธุกรรมที่ใช้ในการตรวจวิเคราะห์เปรียบเทียบจึงเป็นทางหนึ่งที่จะช่วยในการเลือกตัวอย่างและวิธีการตรวจวิเคราะห์ที่เหมาะสมเพื่อให้ได้ DNA profile ที่สมบูรณ์ ในการศึกษาความคงของ short tandem repeat DNA 15 ตำแหน่งและ amelogenin (Sex Chromosome) อีก 1 ตำแหน่ง โดยทำการศึกษาในเนื้อเยื่อมนุษย์ที่ผ่านกระบวนการเน่าตามธรรมชาติ และทำการสกัดสารพันธุกรรมโดยวิธีการสกัด 4 วิธีได้แก่ Phenol-chloroform Extraction, Chelex extraction, silica-base method (QIAampDNA Micro Kit) และ "MasterPure TM” Complete DNA purification kit พบว่าไม่สามารถสกัด DNA ที่มีปริมาณและคุณภาพมากพอที่จะเป็นต้นแบบในการเพิ่มปริมาณโดยกระบวนการ Polymerase Chain Reaction ทั้งนี้อาจมีปัจจัยมาจาก ปริมาณ DNA ที่สกัดได้มีปริมาณน้อยมากและไม่สมบูรณ์ โดยเฉพาะในตำแหน่งที่ใช้สำหรับให้ Primer เกาะอาจเสื่อมสลายหรือขาดหายทำให้การเพิ่มปริมาณ DNA ไม่สำเร็จ นอกจากนี้อาจเป็นผลมาจาก PCR-inhibitors ที่เข้าไปยับยั้งกระบวนการทำงานของปฏิกิริยาการเพิ่มปริมาณ DNA (DNA amplification) ดังนั้นจึงควรเลือกวิธีการตรวจที่มีความไวและมีประสิทธิภาพที่เพียงพอสำหรับการวิเคราะห์ DNA ในปริมาณน้อยมากๆ (Low Copy Number) โดยเฉพาะเข้ามาช่วยอีกทางหนึ่ง เช่น Mini-STR หรือ SNPs เพื่อให้ได้ DNA profile ที่สมบูรณ์สำหรับการตรวจวิเคราะห์เปรียบเทียบต่อไป

Mahidol University

Address: NAKHON PATHOM

Email: liwww@mahidol.ac.th

Name: Worawee Waiyawuth

Role: Thesis Advisors

Created: 2006

Modified: 2025-03-03

Issued: 2010-06-06

วิทยานิพนธ์/Thesis

application/pdf

ISBN: 9740478247

CallNumber: TH A642h 2006

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Grantor: Mahidol University

Descipline: Forensic Science

©copyrights Mahidol University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	4736876.pdf	3.43 MB	14	2019-12-04 16:45:39

ใช้เวลา

0.250612 วินาที