แจ้งเอกสารไม่ครบถ้วน, ไม่ตรงกับชื่อเรื่อง หรือมีข้อผิดพลาดเกี่ยวกับเอกสาร ติดต่อที่นี่ ==>
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
หากไม่มีอีเมลผู้รับให้กรอก thailis-noc@uni.net.th
Surin Peyachoknagul. In silico Promoter Analysis of Photoperiod-Responsive Genes Identified by DNA Microarray in Rice (Oryza sativa L.). (). Kasetsart University. Office of the University Library. : , .
In silico Promoter Analysis of Photoperiod-Responsive Genes Identified by DNA Microarray in Rice (Oryza sativa L.)
Organization :
Kasetsart University. Faculty of Science. Department of Genetics
Name: Pradit Pongtongkam
Organization :
Kasetsart University. Faculty of Science. Department of Genetics
Name: Surin Peyachoknagul
Organization :
Kasetsart University. Faculty of Science. Department of Genetics
keyword:
in silico promoter
;
rice
Abstract:
The bioinformatics tools, in silico analysis, were used to analyze the promoter regions of photoperiod-responsive genes in rice obtained from microarray analysis. The results revealed that the common feature of a photoperiod-responsive promoter is the combination of various light-responsive elements, hormone-responsive elements and stress-responsive elements. This indicated that the photoperiod response is controlled by light in coordination with hormones and stresses. The coordinated motifs, integrating hormones and stresses to photoperiod responses were identified. The GARE motif and G-box are the coordinated motifs integrating gibberellins with photoperiod while MBS and G-box are the coordinated motifs integrating ethylene or abscisic acid and stresses with photoperiod. Moreover, the specific organization of cis-regulatory elements was used to identify phytochrome A (phyA)-regulated genes. The data showed that phyA is involved in the expression of flowering-time genes either by the activation of floral inducers or the suppression of floral repressors. In addition, two novel cis-regulatory elements which are specific to day-length were identified. The novel A-rich element is specific to long daylight and is involved in the regulation of phyA and circadian rhythm to inhibit flowering whereas the novel GC element is specific to short daylight and involved in the regulation of gibberellin signaling to promote flowering. In conclusion, photoperiodic flowering in rice is controlled, partially, by phyA in coordination with A-rich and GC elements.
Kasetsart University. Office of the University Library
Address:
BANGKOK
Email:
tdckulib@ku.ac.th
Modified:
2009-08-15
Issued:
2009-08-15
บทความ/Article
application/pdf
วิทยาสารเกษตรศาสตร์ (วิทยาศาสตร์), 43(1) หน้า 164-177
eng
©copyrights Kasetsart University
RightsAccess:
ใช้เวลา
0.028055 วินาที
Chareerat Mongkolsiriwatana
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| In silico Promoter Analysis of Photoperiod-Responsive Genes Identified by DNA Microarray in Rice (Oryza sativa L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Chareerat Mongkolsiriwatana;Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Expression analysis of photoperiod responsive genes in rice (Oryza sativa L.) KDML 105
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Chareerat Mongkolsiriwatana | Surin Peyachoknagul | วิทยานิพนธ์/Thesis |
Pradit Pongtongkam
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| Diallel analysis of several agronomic traits in maize (Zea mays L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam | วิทยานิพนธ์/Thesis | |
| In silico Promoter Analysis of Photoperiod-Responsive Genes Identified by DNA Microarray in Rice (Oryza sativa L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Chareerat Mongkolsiriwatana;Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Anther Culture of BC1F1 (KDML105//IRBB5/KDML105) Hybrid to Produce Bacterial Blight Resistance Doubled Haploid Rice
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Supanyika Sengsai;Surin Peyachoknagul;Prapa Sripichitt;Amara Thongpan;Pradit Pongtongkam | บทความ/Article | |
| Detection of Photoperiod Responsive Gene in KDML 105 Rice (Oryza sativa L.) using cDNA-SRAP Technique
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Choochai Nettuwakul;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Production of Salt Tolerant Ruzi Grass (Brachiaria ruziziensis) by Tissue Culture
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Dirida Manawiboon;Jantakarn Arananant;Amara Thongpan;Sayan Tudsri | บทความ/Article | |
| Hd1, Hd3a, and Hd6 Genes : Possible DNA Methylation Roles in Photoperiod Sensitive Gene Regulation of Rice KDML 105 (Oryza sativa L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Peerapat Roongsattham;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Lily Kaveeta;Poontariga Harinasut;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Production of Salt Tolerance Dwarf Napier Grass (Pennisetum purpureum cv. Mott) Using Tissue Culture and Gamma Irradiation
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Jantakarn Arananant;Amara Thongpan;Sayan Tudsri | บทความ/Article | |
| Inducing Salt Tolerance in Purple Guinea Grass (Panicum maximum TD58) via Gamma Irradiation and Tissue Culture
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Sumol Nilratnisakorn;Surin Piyachoknakul;Amara Thongpan;Jantakarn Aranananth;Krisana Kowitwanich;Sayan Tadsri | บทความ/Article | |
| DNA Methylation Differences in the Genes Responded to Photoperiod in Rice Cultivar KDML 105
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Surin Peyachoknagul;Wirat Pipatpongpinyo;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Lily Kaveeta;Poontariga Harinasut | บทความ/Article | |
| Heterosis and Combining Ability for Yield and Yield Components of Cotton (Gossypium hirsutum L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Desalegn, Zerihun;Ngamchuen Ratanadilok;Rungsarid Kaveeta;Pradit Pongtongkam;Ananchai Kuantham | บทความ/Article | |
| Evaluation of F1 and F2 Generations for Yield and Yield Components and Fiber Quality Parameters on Cotton (Gossypium hirsutum L.) Under Werer, Ethiopia Condition
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Desalegn, Zerihun;Ngamchuen Ratanadilok;Rungsarid Kaveeta;Pradit Pongtongkam; Ananchai Kuantham | บทความ/Article | |
| Effects of L-lysine on Callus Formation , Plant Regeneration and Flowering of Thai Rice c.v. KDML 105
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Prapa Sripichit;Amara Thongpan;Kanchana Klakhaeng;Saowanee Ketsagul;Kanokporn Lertsirirungson | บทความ/Article |
Surin Peyachoknagul
| Title | Contributor | Type |
|---|---|---|
| In silico Promoter Analysis of Photoperiod-Responsive Genes Identified by DNA Microarray in Rice (Oryza sativa L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Chareerat Mongkolsiriwatana;Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Anther Culture of BC1F1 (KDML105//IRBB5/KDML105) Hybrid to Produce Bacterial Blight Resistance Doubled Haploid Rice
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Supanyika Sengsai;Surin Peyachoknagul;Prapa Sripichitt;Amara Thongpan;Pradit Pongtongkam | บทความ/Article | |
| Detection of Photoperiod Responsive Gene in KDML 105 Rice (Oryza sativa L.) using cDNA-SRAP Technique
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Choochai Nettuwakul;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Species Identification of 3 Hypsibarbus spp. (Pisces: Cyprinidae) Using PCRRFLP of Cytochrome b Gene
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pattanee Jantrarotai;Surapop Sutthiwises;Wongpathom Kamonrat;Surin Peyachoknagul;Chavalit Vidthayanon | บทความ/Article | |
| Production of Salt Tolerant Ruzi Grass (Brachiaria ruziziensis) by Tissue Culture
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Dirida Manawiboon;Jantakarn Arananant;Amara Thongpan;Sayan Tudsri | บทความ/Article | |
| Hd1, Hd3a, and Hd6 Genes : Possible DNA Methylation Roles in Photoperiod Sensitive Gene Regulation of Rice KDML 105 (Oryza sativa L.)
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Peerapat Roongsattham;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Lily Kaveeta;Poontariga Harinasut;Surin Peyachoknagul | บทความ/Article | |
| Production of Salt Tolerance Dwarf Napier Grass (Pennisetum purpureum cv. Mott) Using Tissue Culture and Gamma Irradiation
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Jantakarn Arananant;Amara Thongpan;Sayan Tudsri | บทความ/Article | |
| DNA Methylation Differences in the Genes Responded to Photoperiod in Rice Cultivar KDML 105
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Surin Peyachoknagul;Wirat Pipatpongpinyo;Pradit Pongtongkam;Amara Thongpan;Lily Kaveeta;Poontariga Harinasut | บทความ/Article | |
| Effects of L-lysine on Callus Formation , Plant Regeneration and Flowering of Thai Rice c.v. KDML 105
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ Pradit Pongtongkam;Surin Peyachoknagul;Prapa Sripichit;Amara Thongpan;Kanchana Klakhaeng;Saowanee Ketsagul;Kanokporn Lertsirirungson | บทความ/Article | |
| Population analysis of Epipactis flava Seidenf in Thailand using SRAP and RAPD markers
มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์. สำนักทรัพยากรการเรียนรู้คุณหญิงหลง อรรถกระวีสุนทร Waroon Suwankitti;Sirinat Wankaew;Boonsita La-ongdet;Surin Peyachoknagul;Somjit Homchan;Anupan Kongbangkerd;Maliwan Nakkuntod | บทความ/Article |