Bioactive compounds from endophytic fungi Phomopsis sp. from Urobotrya siamensis and isolate LRUB 20 from Leea rubra

สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากราเอนโดไฟต์ Phomopsis sp. จากผักหวานมา Urobotrya siamensis และไอโซเลต LRUB 20 จากกะตังใบ Leea rubra

Name: Porntep Chomcheon

LCSH: Bioactive compounds

LCSH: Urobotrya siamensis

LCSH: Leea rubra

LCSH: Endophytic fungi

Abstract: The purpose of this research was to isolate bioactive compounds from endophytic fungi isolate LRUB 20 from Leea rubra Blume Ex Spreng. and isolate USIA 5 from Urobotrya siamensis Hiepko. Crude extract of endophytic fungus isolate LRUB 20 was purified by chromatographic techniques to afford three compounds, which were identified as asterric acid, 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopent-2-enone, and 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopentanone. The crude extract of endophytic fungus isolate USIA 5 provided 3-nitropropionic acid. The chemical structures of the isolated compounds were elucidated through extensive analyses of UV, IR, MS, and NMR and by comparison with literature. Asterric acid, 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopent-2-enone, and 3-nitropropionic acid were found to exhibit activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv with the MIC values of 200, 200, and 0.39 g/ml, respectively. Based on morphology and nucleotide sequences of ITS1-5.8S-ITS2 regions of rDNA, endophytic fungus isolate USIA 5 was identified as Phomopsis sp. in the family Diaporthaceae. While based on morphology, the fungus isolate LRUB 20 limited in spore formation. Nucleotide sequences of ITS1-5.8S-ITS2 regions of rDNA were applied to classify endophytic fungus isolate LRUB 20, which was found to be in the family Magnaporthaceae.

Abstract: งานวิจัยนี้ทำการแยกสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพจากราเอนโดไฟต์ไอโซเลต LRUB 20 ที่แยกได้จากกิ่งกะตังใบ และไอโซเลต USIA 5 ที่แยกได้จากใบผักหวานเมา โดยนำสารสกัดหยาบจากราเอนโดไฟต์ไอโซเลต LRUB 20 มาทำการแยกสารบริสุทธิ์โดยเทคนิคโครมาโทกราฟีได้สาร 3 ชนิด คือ asterric acid, 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopent-2-enone และ 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopentanone ในขณะที่สารสกัดหยาบจากราเอนโดไฟต์ไอโซเลต USIA 5 แยกสารบริสุทธิ์ได้ 1 ชนิด คือ 3-nitropropionic acid การพิสูจน์โครงสร้างทางเคมีของสารเหล่านี้ใช้วิธีการวิเคราะห์ข้อมูล UV, IR, MS, และ NMR ร่วมกับการเปรียบเทียบข้อมูลที่มีรายงานมาแล้ว เมื่อนำสารบริสุทธิ์ที่แยกได้ไปทดสอบฤทธิ์ทางชีวภาพ พบว่า สาร asterric acid, 2-hydroxymethyl-3-methyl-cyclopent-2-enone และ 3-nitropropionic acid แสดงฤทธิ์ต้านเชื้อ Mycobacterium tuberculosis H37Rv ด้วยค่า MIC เท่ากับ 200, 200 และ 0.39 g/ml ตามลำดับ การศึกษาทางสัณฐานวิทยาและการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ในบริเวณ ITS1-5.8S-ITS2 ของ rDNA สามารถจำแนกประเภทราเอนโดไฟต์ไอโซเลต USIA 5 คือ Phomopsis sp. ในวงศ์ Diaporthaceae ขณะที่การศึกษาทางสัณฐานวิทยาพบว่าราเอนโดไฟต์ไอโซเลต LRUB 20 ไม่สร้างสปอร์ จึงทำการจำแนกประเภทโดยการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ในบริเวณ ITS1-5.8S-ITS2 ของ rDNA สามารถจำแนกประเภทราเอนโดไฟต์ไอโซเลต LRUB 20 ไว้ในวงศ์ Magnaporthaceae

Chulalongkorn University

Address: กรุงเทพมหานคร (Bangkok)

Email: cuir@car.chula.ac.th

Name: Nattaya Ngamrojanavanich

Role: Advisor

Name: Nongluksna Sriubolmas

Role: Advisor

Name: Prasat Kittakoop

Role: Advisor

Created: 2004

Issued: 2006-03-06

Modified: 2006-05-10

วิทยานิพนธ์/Thesis

URL: http://thailis-db.car.chula.ac.th/CU_DC/Thesis/February2006/Porntep.pdf

ISBN: 9745315516

eng

DegreeName: Master of Science

Level: Master's Degree

Descipline: Biotechnology

Grantor: Chulalongkorn University

©copyrights Chulalongkorn University

ลำดับที่.	ชื่อแฟ้มข้อมูล	ขนาดแฟ้มข้อมูล	จำนวนเข้าถึง	วัน-เวลาเข้าถึงล่าสุด
1	Porntep.pdf	14.16 MB	107	2021-03-09 09:09:37

ใช้เวลา

0.035331 วินาที